Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0986 Pepper.v.1.5.chr03 223957514 1e-153
CaES1685 Pepper.v.1.5.chr03 224125887 1e-111
CaES5619 Pepper.v.1.5.chr03 224208984 1e-133
CaES1963 Pepper.v.1.5.chr03 224673996 4e-92
CaES0255 Pepper.v.1.5.chr03 224674219 4e-66
CaES4558 Pepper.v.1.5.chr03 224852535 1e-110
CaES2134 Pepper.v.1.5.chr03 224887241 1e-144
CaES5000 Pepper.v.1.5.chr03 225050859 1e-109
CaES3517 Pepper.v.1.5.chr03 225093995 5e-27
CaES3777 Pepper.v.1.5.chr03 225176621 1e-154
CaES1234 Pepper.v.1.5.chr03 225177981 1e-137
CaES2199 Pepper.v.1.5.chr03 225324705 2e-83
CaES1171 Pepper.v.1.5.chr03 225385740 1e-154
CaES2498 Pepper.v.1.5.chr03 225385752 2e-65
CaES1878 Pepper.v.1.5.chr03 225488457 2e-45
CaES3397 Pepper.v.1.5.chr03 225669222 1e-111
CaES3222 Pepper.v.1.5.chr03 225955242 8e-52
CaES5073 Pepper.v.1.5.chr03 225962909 1e-109
CaES3403 Pepper.v.1.5.chr03 226078664 1e-128
CaES1841 Pepper.v.1.5.chr03 226080286 1e-72
CaES0318 Pepper.v.1.5.chr03 226130569 3e-50
CaES5625 Pepper.v.1.5.chr03 226311560 1e-103
CaES4930 Pepper.v.1.5.chr03 226841354 1e-118
CaES1416 Pepper.v.1.5.chr03 226992669 1e-106
CaES1998 Pepper.v.1.5.chr03 227514319 1e-138
CaES5573 Pepper.v.1.5.chr03 228095084 1e-104
CaES3892 Pepper.v.1.5.chr03 228186750 4e-96
CaES2442 Pepper.v.1.5.chr03 228740467 5e-98
CaES3039 Pepper.v.1.5.chr03 228998851 6e-59
CaES4055 Pepper.v.1.5.chr03 229395669 1e-145
CaES5389 Pepper.v.1.5.chr03 229396260 9e-52
CaES1072 Pepper.v.1.5.chr03 230571615 1e-88
CaES5182 Pepper.v.1.5.chr03 230591895 9e-42
CaES1022 Pepper.v.1.5.chr03 230654459 1e-122
CaES4123 Pepper.v.1.5.chr03 230747923 1e-79
CaES1056 Pepper.v.1.5.chr03 231160559 1e-133
CaES2180 Pepper.v.1.5.chr03 231437239 5e-98
CaES4972 Pepper.v.1.5.chr03 231464921 3e-82
CaES0870 Pepper.v.1.5.chr03 231465211 3e-45
CaES0737 Pepper.v.1.5.chr03 231471554 1e-133
CaES5437 Pepper.v.1.5.chr03 231763202 4e-33
CaES2385 Pepper.v.1.5.chr03 231849865 2e-64
CaES0247 Pepper.v.1.5.chr03 232094741 8e-28
CaES0498 Pepper.v.1.5.chr03 232206010 2e-66
CaES2684 Pepper.v.1.5.chr03 232210662 1e-135
CaES3210 Pepper.v.1.5.chr03 232274183 1e-152
CaES0630 Pepper.v.1.5.chr03 232475993 1e-125
CaES0929 Pepper.v.1.5.chr03 232650527 1e-116
CaES0052 Pepper.v.1.5.chr03 232716638 2e-28
CaES0821 Pepper.v.1.5.chr03 232716732 8e-93
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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