Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2292 Pepper.v.1.5.chr03 2040 4e-92
CaES1876 Pepper.v.1.5.chr03 2846 9e-54
CaES3885 Pepper.v.1.5.chr03 281383 2e-98
CaES3806 Pepper.v.1.5.chr03 725239 1e-119
CaES2496 Pepper.v.1.5.chr03 1024383 1e-84
CaES5399 Pepper.v.1.5.chr03 1026016 1e-98
CaES1722 Pepper.v.1.5.chr03 1173430 1e-111
CaES3051 Pepper.v.1.5.chr03 1216785 2e-82
CaES3367 Pepper.v.1.5.chr03 1235724 1e-115
CaES0429 Pepper.v.1.5.chr03 1238441 4e-61
CaES5193 Pepper.v.1.5.chr03 1448531 1e-155
CaES2550 Pepper.v.1.5.chr03 1744888 1e-134
CaES4231 Pepper.v.1.5.chr03 1745137 8e-85
CaES1289 Pepper.v.1.5.chr03 1749624 2e-81
CaES0552 Pepper.v.1.5.chr03 1774971 3e-80
CaES5728 Pepper.v.1.5.chr03 1777922 1e-40
CaES4069 Pepper.v.1.5.chr03 1945741 2e-84
CaES5306 Pepper.v.1.5.chr03 2223882 1e-112
CaES4651 Pepper.v.1.5.chr03 2232650 1e-149
CaES5158 Pepper.v.1.5.chr03 2430371 4e-97
CaES2792 Pepper.v.1.5.chr03 2449269 6e-26
CaES5706 Pepper.v.1.5.chr03 2698042 2e-82
CaES4977 Pepper.v.1.5.chr03 2796041 1e-79
CaES2457 Pepper.v.1.5.chr03 2858431 1e-56
CaES2308 Pepper.v.1.5.chr03 2877593 1e-104
CaES4193 Pepper.v.1.5.chr03 2888162 3e-24
CaES2110 Pepper.v.1.5.chr03 2888162 5e-26
CaES5745 Pepper.v.1.5.chr03 3278298 3e-51
CaES4546 Pepper.v.1.5.chr03 3704145 1e-119
CaES0649 Pepper.v.1.5.chr03 3721091 1e-120
CaES5336 Pepper.v.1.5.chr03 3744975 1e-101
CaES4590 Pepper.v.1.5.chr03 3745044 2e-33
CaES0559 Pepper.v.1.5.chr03 3776865 2e-25
CaES3015 Pepper.v.1.5.chr03 4100896 1e-134
CaES0898 Pepper.v.1.5.chr03 4102257 1e-137
CaES0979 Pepper.v.1.5.chr03 4462528 2e-26
CaES0851 Pepper.v.1.5.chr03 4524371 1e-129
CaES0777 Pepper.v.1.5.chr03 4578375 1e-139
CaES3234 Pepper.v.1.5.chr03 4587337 1e-154
CaES2245 Pepper.v.1.5.chr03 4600121 1e-109
CaES1145 Pepper.v.1.5.chr03 4662973 2e-22
CaES2560 Pepper.v.1.5.chr03 4744241 3e-71
CaES5572 Pepper.v.1.5.chr03 4815998 1e-66
CaES2144 Pepper.v.1.5.chr03 4816087 3e-89
CaES3830 Pepper.v.1.5.chr03 4816602 1e-154
CaES2678 Pepper.v.1.5.chr03 4878608 1e-137
CaES3576 Pepper.v.1.5.chr03 4882026 4e-85
CaES2866 Pepper.v.1.5.chr03 5067654 1e-129
CaES4838 Pepper.v.1.5.chr03 5115979 1e-94
CaES3322 Pepper.v.1.5.chr03 5121630 1e-49
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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