Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0712 Pepper.v.1.5.chr03 202504545 1e-90
CaES3404 Pepper.v.1.5.chr03 202526065 7e-47
CaES5027 Pepper.v.1.5.chr03 202694898 2e-45
CaES5374 Pepper.v.1.5.chr03 203252878 7e-71
CaES0420 Pepper.v.1.5.chr03 203438153 1e-141
CaES3817 Pepper.v.1.5.chr03 204418166 1e-118
CaES3569 Pepper.v.1.5.chr03 204459901 1e-100
CaES2823 Pepper.v.1.5.chr03 204593190 2e-73
CaES5663 Pepper.v.1.5.chr03 205573637 1e-112
CaES3022 Pepper.v.1.5.chr03 205747215 3e-97
CaES0306 Pepper.v.1.5.chr03 205747799 6e-83
CaES0389 Pepper.v.1.5.chr03 206403376 1e-128
CaES0114 Pepper.v.1.5.chr03 206559603 8e-89
CaES0431 Pepper.v.1.5.chr03 207378586 1e-121
CaES0469 Pepper.v.1.5.chr03 207830804 1e-170
CaES0363 Pepper.v.1.5.chr03 208652227 3e-94
CaES1989 Pepper.v.1.5.chr03 209851279 1e-90
CaES2617 Pepper.v.1.5.chr03 209971858 1e-114
CaES1984 Pepper.v.1.5.chr03 210279046 1e-119
CaES4061 Pepper.v.1.5.chr03 210657825 1e-121
CaES3037 Pepper.v.1.5.chr03 210666909 1e-133
CaES1843 Pepper.v.1.5.chr03 211327636 1e-150
CaES5273 Pepper.v.1.5.chr03 211765517 6e-82
CaES0730 Pepper.v.1.5.chr03 211859747 1e-117
CaES3931 Pepper.v.1.5.chr03 211913246 1e-141
CaES0749 Pepper.v.1.5.chr03 212310097 1e-160
CaES0104 Pepper.v.1.5.chr03 212531480 4e-84
CaES0404 0.321 190 Pepper.v.1.5.chr03 212583251 9e-41
CaES1331 Pepper.v.1.5.chr03 213194399 1e-104
CaES4149 Pepper.v.1.5.chr03 213286901 1e-101
CaES3929 Pepper.v.1.5.chr03 213670791 9e-36
CaES2553 Pepper.v.1.5.chr03 213714687 3e-21
CaES0579 Pepper.v.1.5.chr03 213723768 2e-61
CaES1502 Pepper.v.1.5.chr03 214022521 2e-66
CaES4733 Pepper.v.1.5.chr03 214053195 1e-129
CaES4177 Pepper.v.1.5.chr03 214056540 1e-100
CaES1439 Pepper.v.1.5.chr03 214056540 1e-140
CaES0724 Pepper.v.1.5.chr03 214095254 1e-123
CaES2301 Pepper.v.1.5.chr03 214275631 1e-132
CaES2941 Pepper.v.1.5.chr03 214282074 1e-101
CaES0566 Pepper.v.1.5.chr03 214341315 2e-40
CaES5558 Pepper.v.1.5.chr03 214400511 7e-79
CaES2185 Pepper.v.1.5.chr03 214402832 1e-102
CaES2094 Pepper.v.1.5.chr03 214422572 7e-95
CaES5718 Pepper.v.1.5.chr03 214467832 1e-107
CaES0075 Pepper.v.1.5.chr03 214506187 1e-122
CaES0066 Pepper.v.1.5.chr03 214625782 2e-97
CaES3836 Pepper.v.1.5.chr03 214804185 1e-105
CaES4365 Pepper.v.1.5.chr03 214870193 1e-133
CaES0350 Pepper.v.1.5.chr03 214871936 1e-63
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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