Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2655 0.704 189 Pepper.v.1.5.chr03 5156778 1e-126
CaES3483 Pepper.v.1.5.chr03 5460367 3e-90
CaES5441 Pepper.v.1.5.chr03 5605051 2e-33
CaES3685 Pepper.v.1.5.chr03 5623120 1e-148
CaES0916 Pepper.v.1.5.chr03 5687943 2e-48
CaES2805 Pepper.v.1.5.chr03 5838236 1e-138
CaES2419 Pepper.v.1.5.chr03 6253281 1e-125
CaES5646 Pepper.v.1.5.chr03 7268093 2e-46
CaES4278 Pepper.v.1.5.chr03 7280732 1e-106
CaES3370 Pepper.v.1.5.chr03 7437581 3e-49
CaES3753 Pepper.v.1.5.chr03 7559233 1e-104
CaES3971 Pepper.v.1.5.chr03 7949252 1e-116
CaES5734 Pepper.v.1.5.chr03 8018655 8e-59
CaES0710 Pepper.v.1.5.chr03 8020780 1e-111
CaES4175 Pepper.v.1.5.chr03 8050985 2e-99
CaES5450 Pepper.v.1.5.chr03 8228999 6e-91
CaES5544 Pepper.v.1.5.chr03 8395589 1e-124
CaES2471 Pepper.v.1.5.chr03 8403357 3e-69
CaES1263 Pepper.v.1.5.chr03 8858172 5e-39
CaES1719 Pepper.v.1.5.chr03 9169743 1e-124
CaES3776 Pepper.v.1.5.chr03 9218496 4e-80
CaES4869 Pepper.v.1.5.chr03 10251755 1e-116
CaES2666 0.381 191 Pepper.v.1.5.chr03 10330496 1e-136
CaES3600 Pepper.v.1.5.chr03 11254243 1e-126
CaES4688 Pepper.v.1.5.chr03 11532674 7e-67
CaES5286 Pepper.v.1.5.chr03 11685477 1e-90
CaES3877 Pepper.v.1.5.chr03 11709869 1e-87
CaES4796 Pepper.v.1.5.chr03 12114738 8e-80
CaES3900 Pepper.v.1.5.chr03 12232610 1e-98
CaES1958 Pepper.v.1.5.chr03 13057670 2e-79
CaES0837 Pepper.v.1.5.chr03 13058963 6e-58
CaES1927 Pepper.v.1.5.chr03 13101580 1e-123
CaES3467 Pepper.v.1.5.chr03 13300357 9e-97
CaES5407 Pepper.v.1.5.chr03 13321585 1e-140
CaES2967 Pepper.v.1.5.chr03 13993821 1e-103
CaES1900 Pepper.v.1.5.chr03 14474782 4e-37
CaES3395 Pepper.v.1.5.chr03 14474782 2e-35
CaES4130 Pepper.v.1.5.chr03 14953670 3e-30
CaES3769 Pepper.v.1.5.chr03 15018078 1e-108
CaES1295 Pepper.v.1.5.chr03 15589539 3e-97
CaES1949 Pepper.v.1.5.chr03 15646462 1e-162
CaES1594 Pepper.v.1.5.chr03 16113617 8e-44
CaES4101 Pepper.v.1.5.chr03 16113785 7e-50
CaES1699 Pepper.v.1.5.chr03 16231414 9e-69
CaES2689 Pepper.v.1.5.chr03 16232990 6e-90
CaES4842 Pepper.v.1.5.chr03 16681837 3e-46
CaES0072 Pepper.v.1.5.chr03 17399366 7e-93
CaES4081 Pepper.v.1.5.chr03 17762413 1e-135
CaES4341 Pepper.v.1.5.chr03 17787450 3e-72
CaES2874 Pepper.v.1.5.chr03 17904243 5e-38
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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