Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES4347 Pepper.v.1.5.chr10 211517589 1e-120
CaES0932 Pepper.v.1.5.chr10 211533779 1e-122
CaES2570 Pepper.v.1.5.chr10 213160919 3e-96
CaES1046 Pepper.v.1.5.chr10 213217894 1e-128
CaES0747 Pepper.v.1.5.chr10 213219810 1e-123
CaES1429 Pepper.v.1.5.chr10 213908389 1e-46
CaES3076 Pepper.v.1.5.chr10 213986537 1e-118
CaES2525 Pepper.v.1.5.chr10 214436313 2e-73
CaES5230 Pepper.v.1.5.chr10 214781112 8e-98
CaES1158 Pepper.v.1.5.chr10 215700781 5e-66
CaES3654 Pepper.v.1.5.chr10 215710120 1e-64
CaES2647 Pepper.v.1.5.chr10 215710594 1e-101
CaES1313 Pepper.v.1.5.chr10 216298253 5e-70
CaES4650 Pepper.v.1.5.chr10 216553922 1e-126
CaES1528 Pepper.v.1.5.chr10 216795075 3e-84
CaES4802 Pepper.v.1.5.chr10 216814454 1e-115
CaES5660 Pepper.v.1.5.chr10 216840037 2e-81
CaES0880 Pepper.v.1.5.chr10 216849571 1e-145
CaES4240 Pepper.v.1.5.chr10 216851394 6e-70
CaES3153 Pepper.v.1.5.chr10 217008921 1e-130
CaES3633 Pepper.v.1.5.chr10 217565376 4e-83
CaES0037 Pepper.v.1.5.chr10 217736446 1e-124
CaES4189 Pepper.v.1.5.chr10 217791544 3e-80
CaES2566 Pepper.v.1.5.chr10 217867251 8e-30
CaES2819 Pepper.v.1.5.chr10 217899915 1e-114
CaES4448 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr10 217977921 1e-103
CaES4508 Pepper.v.1.5.chr10 218503779 5e-94
CaES3104 Pepper.v.1.5.chr10 218928637 3e-32
CaES3477 Pepper.v.1.5.chr10 219227948 1e-130
CaES5507 Pepper.v.1.5.chr10 219287898 1e-51
CaES2124 Pepper.v.1.5.chr10 219433657 6e-60
CaES4379 Pepper.v.1.5.chr10 219501415 6e-75
CaES1076 Pepper.v.1.5.chr10 219568469 4e-93
CaES4275 Pepper.v.1.5.chr10 219655434 1e-157
CaES2432 Pepper.v.1.5.chr10 219704431 1e-100
CaES1537 Pepper.v.1.5.chr10 221153360 1e-38
CaES2042 Pepper.v.1.5.chr10 221185651 1e-100
CaES1705 Pepper.v.1.5.chr10 221247550 1e-113
CaES2752 Pepper.v.1.5.chr10 221302200 1e-105
CaES4991 Pepper.v.1.5.chr10 221361220 1e-145
CaES2398 Pepper.v.1.5.chr10 221642718 2e-84
CaES0525 Pepper.v.1.5.chr10 221689642 5e-28
CaES1327 Pepper.v.1.5.chr10 221738697 1e-135
CaES0805 Pepper.v.1.5.chr10 222063177 1e-101
CaES3851 Pepper.v.1.5.chr10 222137644 1e-132
CaES5461 Pepper.v.1.5.chr10 222137771 5e-92
CaES0106 Pepper.v.1.5.chr10 222154033 1e-131
CaES4620 Pepper.v.1.5.chr10 222306827 1e-141
CaES4304 Pepper.v.1.5.chr10 222566213 1e-104
CaES3707 Pepper.v.1.5.chr10 222567831 1e-139
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390

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