Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4541 Pepper.v.1.5.chr10 187932646 1e-140
CaES2029 Pepper.v.1.5.chr10 187937433 5e-99
CaES4128 Pepper.v.1.5.chr10 188131094 7e-59
CaES5740 Pepper.v.1.5.chr10 188577162 2e-99
CaES1108 Pepper.v.1.5.chr10 188614370 1e-35
CaES1058 Pepper.v.1.5.chr10 189014998 1e-116
CaES5601 Pepper.v.1.5.chr10 189962020 2e-76
CaES0927 Pepper.v.1.5.chr10 190235657 3e-84
CaES2837 Pepper.v.1.5.chr10 190237428 8e-57
CaES3622 Pepper.v.1.5.chr10 191408991 1e-116
CaES0192 Pepper.v.1.5.chr10 192287477 1e-110
CaES3975 Pepper.v.1.5.chr10 193354666 5e-64
CaES2802 Pepper.v.1.5.chr10 193961646 1e-134
CaES5233 Pepper.v.1.5.chr10 194388486 1e-102
CaES0670 Pepper.v.1.5.chr10 195310593 1e-144
CaES3782 Pepper.v.1.5.chr10 195791117 3e-96
CaES5078 Pepper.v.1.5.chr10 195806225 1e-125
CaES1823 Pepper.v.1.5.chr10 196066604 1e-134
CaES1202 Pepper.v.1.5.chr10 196288349 1e-133
CaES1203 Pepper.v.1.5.chr10 196295115 1e-130
CaES2355 Pepper.v.1.5.chr10 196419529 2e-27
CaES0138 Pepper.v.1.5.chr10 199530742 1e-115
CaES0955 Pepper.v.1.5.chr10 199751779 1e-122
CaES4660 Pepper.v.1.5.chr10 200383330 1e-137
CaES1064 Pepper.v.1.5.chr10 200892121 1e-77
CaES4367 Pepper.v.1.5.chr10 200987757 1e-127
CaES1701 Pepper.v.1.5.chr10 201291016 1e-109
CaES0966 Pepper.v.1.5.chr10 201552223 2e-88
CaES0140 Pepper.v.1.5.chr10 201797201 1e-41
CaES5700 Pepper.v.1.5.chr10 202122230 1e-102
CaES5578 Pepper.v.1.5.chr10 202246228 7e-73
CaES1726 Pepper.v.1.5.chr10 202931308 2e-57
CaES5596 Pepper.v.1.5.chr10 203595155 7e-42
CaES0652 Pepper.v.1.5.chr10 203890368 1e-104
CaES2729 Pepper.v.1.5.chr10 204252249 1e-155
CaES2317 Pepper.v.1.5.chr10 204816366 9e-89
CaES3050 Pepper.v.1.5.chr10 204924200 1e-147
CaES3584 Pepper.v.1.5.chr10 205319614 1e-110
CaES4297 Pepper.v.1.5.chr10 205412371 9e-68
CaES4862 Pepper.v.1.5.chr10 205434981 4e-54
CaES0584 Pepper.v.1.5.chr10 207100899 7e-93
CaES1723 Pepper.v.1.5.chr10 207104437 1e-120
CaES1795 Pepper.v.1.5.chr10 207443030 2e-36
CaES5649 Pepper.v.1.5.chr10 207443409 1e-66
CaES0307 Pepper.v.1.5.chr10 207700781 1e-118
CaES1090 Pepper.v.1.5.chr10 208033168 2e-95
CaES0378 Pepper.v.1.5.chr10 208034926 1e-115
CaES5131 Pepper.v.1.5.chr10 210161883 4e-33
CaES2345 Pepper.v.1.5.chr10 210198668 2e-48
CaES2352 Pepper.v.1.5.chr10 210340322 2e-54
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390


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