Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2119 Pepper.v.1.5.chr10 37105682 2e-50
CaES5226 Pepper.v.1.5.chr10 38039327 8e-70
CaES4201 Pepper.v.1.5.chr10 38204727 1e-128
CaES3796 Pepper.v.1.5.chr10 38247912 1e-110
CaES5671 Pepper.v.1.5.chr10 38354397 1e-104
CaES1155 Pepper.v.1.5.chr10 40148434 3e-84
CaES3545 Pepper.v.1.5.chr10 40150989 1e-120
CaES1742 Pepper.v.1.5.chr10 42834626 1e-64
CaES4488 Pepper.v.1.5.chr10 42852751 1e-114
CaES2830 Pepper.v.1.5.chr10 44377461 1e-33
CaES2277 Pepper.v.1.5.chr10 44593404 1e-165
CaES1557 Pepper.v.1.5.chr10 45598293 1e-36
CaES3489 Pepper.v.1.5.chr10 46373740 1e-25
CaES1428 Pepper.v.1.5.chr10 46472477 1e-104
CaES5136 Pepper.v.1.5.chr10 46472873 7e-37
CaES0374 Pepper.v.1.5.chr10 46496821 2e-88
CaES1904 Pepper.v.1.5.chr10 49141963 2e-89
CaES3214 Pepper.v.1.5.chr10 55923995 0.0
CaES2067 Pepper.v.1.5.chr10 55926913 1e-137
CaES5692 Pepper.v.1.5.chr10 56280599 1e-118
CaES4457 Pepper.v.1.5.chr10 58855178 1e-125
CaES4173 Pepper.v.1.5.chr10 60024624 1e-105
CaES3423 Pepper.v.1.5.chr10 60605481 7e-87
CaES4714 Pepper.v.1.5.chr10 60610085 1e-138
CaES4454 Pepper.v.1.5.chr10 61943410 6e-60
CaES5465 Pepper.v.1.5.chr10 61943717 2e-98
CaES0342 Pepper.v.1.5.chr10 62140557 3e-30
CaES1504 Pepper.v.1.5.chr10 62818060 2e-91
CaES5304 Pepper.v.1.5.chr10 62820819 1e-101
CaES1715 Pepper.v.1.5.chr10 62901726 2e-96
CaES3169 Pepper.v.1.5.chr10 66045534 7e-66
CaES3030 Pepper.v.1.5.chr10 67486990 1e-115
CaES2168 Pepper.v.1.5.chr10 67489036 1e-100
CaES0434 Pepper.v.1.5.chr10 67495402 2e-62
CaES0354 Pepper.v.1.5.chr10 70483627 2e-31
CaES0891 Pepper.v.1.5.chr10 72980407 1e-137
CaES1069 Pepper.v.1.5.chr10 73182615 1e-122
CaES2608 Pepper.v.1.5.chr10 73759940 1e-101
CaES3518 Pepper.v.1.5.chr10 74013296 3e-51
CaES1840 Pepper.v.1.5.chr10 74613761 1e-123
CaES4694 Pepper.v.1.5.chr10 74902039 2e-40
CaES4058 Pepper.v.1.5.chr10 75589979 9e-50
CaES4820 Pepper.v.1.5.chr10 77964740 2e-80
CaES2315 Pepper.v.1.5.chr10 78795202 6e-75
CaES3173 Pepper.v.1.5.chr10 79457788 4e-75
CaES0089 0.89 128 Pepper.v.1.5.chr10 81926696 1e-121
CaES2297 Pepper.v.1.5.chr10 82184686 1e-101
CaES4326 Pepper.v.1.5.chr10 82342438 1e-69
CaES5155 Pepper.v.1.5.chr10 83815940 1e-113
CaES1727 Pepper.v.1.5.chr10 84445165 2e-80
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390


MarkerDB | Capsicum annuum