Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1697 Pepper.v.1.5.chr10 84445711 7e-66
CaES1093 Pepper.v.1.5.chr10 85482757 1e-63
CaES1458 Pepper.v.1.5.chr10 85972104 4e-69
CaES1239 Pepper.v.1.5.chr10 86770631 1e-111
CaES5186 Pepper.v.1.5.chr10 86791287 2e-90
CaES4892 Pepper.v.1.5.chr10 86793024 1e-133
CaES4395 Pepper.v.1.5.chr10 87134245 1e-142
CaES3736 Pepper.v.1.5.chr10 87135343 1e-127
CaES5433 Pepper.v.1.5.chr10 87637383 1e-76
CaES4291 Pepper.v.1.5.chr10 88921243 2e-43
CaES0282 Pepper.v.1.5.chr10 89080094 1e-42
CaES5748 Pepper.v.1.5.chr10 93995710 6e-95
CaES3586 Pepper.v.1.5.chr10 95696452 1e-115
CaES5104 Pepper.v.1.5.chr10 95912042 7e-88
CaES4281 Pepper.v.1.5.chr10 96074583 1e-105
CaES2262 Pepper.v.1.5.chr10 96608196 1e-112
CaES1541 Pepper.v.1.5.chr10 96608556 1e-72
CaES4984 Pepper.v.1.5.chr10 97753410 2e-51
CaES3930 Pepper.v.1.5.chr10 98767047 1e-138
CaES0848 Pepper.v.1.5.chr10 100676497 3e-30
CaES1353 Pepper.v.1.5.chr10 105733059 1e-106
CaES2433 Pepper.v.1.5.chr10 106260750 1e-103
CaES5468 Pepper.v.1.5.chr10 108063346 1e-40
CaES0109 Pepper.v.1.5.chr10 108923284 1e-134
CaES3134 Pepper.v.1.5.chr10 110426171 2e-62
CaES4062 Pepper.v.1.5.chr10 111025024 1e-145
CaES2691 Pepper.v.1.5.chr10 111948188 1e-102
CaES3703 Pepper.v.1.5.chr10 114093733 6e-34
CaES3457 Pepper.v.1.5.chr10 114093751 6e-74
CaES4814 Pepper.v.1.5.chr10 114093817 9e-45
CaES1075 Pepper.v.1.5.chr10 115656990 1e-129
CaES5059 Pepper.v.1.5.chr10 115670741 1e-109
CaES2671 Pepper.v.1.5.chr10 118156448 1e-109
CaES0746 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr10 118590300 2e-82
CaES2281 Pepper.v.1.5.chr10 121165874 1e-148
CaES2688 Pepper.v.1.5.chr10 121353364 1e-113
CaES2873 Pepper.v.1.5.chr10 121353910 1e-145
CaES0982 Pepper.v.1.5.chr10 121788775 1e-107
CaES3230 Pepper.v.1.5.chr10 121932753 2e-30
CaES3770 Pepper.v.1.5.chr10 126861874 2e-45
CaES2098 Pepper.v.1.5.chr10 126876906 6e-70
CaES2099 Pepper.v.1.5.chr10 126876920 2e-32
CaES3521 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr10 129470731 1e-127
CaES2567 Pepper.v.1.5.chr10 132631265 8e-98
CaES1620 Pepper.v.1.5.chr10 132631265 1e-108
CaES2118 Pepper.v.1.5.chr10 133998601 4e-55
CaES3250 Pepper.v.1.5.chr10 134927413 1e-60
CaES1329 Pepper.v.1.5.chr10 134927722 1e-43
CaES4601 Pepper.v.1.5.chr10 135472454 2e-92
CaES0704 Pepper.v.1.5.chr10 136014828 3e-23
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390


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