Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES5081 Pepper.v.1.5.chr02 155707817 6e-80
CaES5652 Pepper.v.1.5.chr02 155883132 1e-122
CaES3768 Pepper.v.1.5.chr02 155942550 1e-104
CaES1898 Pepper.v.1.5.chr02 155975212 1e-118
CaES1447 Pepper.v.1.5.chr02 155982864 1e-113
CaES2864 Pepper.v.1.5.chr02 156069045 1e-132
CaES4867 Pepper.v.1.5.chr02 156145598 7e-46
CaES4727 Pepper.v.1.5.chr02 156200228 1e-117
CaES3492 Pepper.v.1.5.chr02 156379874 5e-46
CaES3461 Pepper.v.1.5.chr02 156411978 1e-112
CaES4850 Pepper.v.1.5.chr02 156413368 1e-128
CaES0078 Pepper.v.1.5.chr02 156600820 1e-125
CaES3967 Pepper.v.1.5.chr02 156607140 1e-126
CaES3143 Pepper.v.1.5.chr02 156841471 1e-144
CaES2593 Pepper.v.1.5.chr02 156902996 2e-77
CaES5453 Pepper.v.1.5.chr02 157391544 1e-94
CaES4307 Pepper.v.1.5.chr02 157446516 1e-137
CaES0871 Pepper.v.1.5.chr02 157534125 4e-69
CaES2520 Pepper.v.1.5.chr02 157648270 6e-76
CaES4726 Pepper.v.1.5.chr02 157651263 1e-119
CaES1698 Pepper.v.1.5.chr02 157680756 1e-116
CaES5038 Pepper.v.1.5.chr02 157681087 1e-29
CaES3664 Pepper.v.1.5.chr02 157730565 1e-106
CaES4918 Pepper.v.1.5.chr02 157742249 1e-116
CaES2128 Pepper.v.1.5.chr02 157777611 6e-57
CaES2141 Pepper.v.1.5.chr02 157779935 1e-109
CaES1556 Pepper.v.1.5.chr02 157899339 4e-84
CaES0873 Pepper.v.1.5.chr02 157976887 1e-158
CaES1004 Pepper.v.1.5.chr02 158121009 1e-115
CaES3958 0.367 192 Pepper.v.1.5.chr02 158333086 2e-28
CaES0402 Pepper.v.1.5.chr02 158333953 1e-117
CaES4136 Pepper.v.1.5.chr02 158408232 1e-110
CaES5566 Pepper.v.1.5.chr02 158596318 1e-97
CaES4852 Pepper.v.1.5.chr02 158621386 7e-81
CaES0422 Pepper.v.1.5.chr02 158718226 1e-121
CaES0281 Pepper.v.1.5.chr02 158785452 1e-120
CaES0451 Pepper.v.1.5.chr02 158917605 8e-61
CaES4335 Pepper.v.1.5.chr02 158981729 3e-61
CaES1125 Pepper.v.1.5.chr02 158993207 1e-104
CaES4132 Pepper.v.1.5.chr02 159068647 1e-144
CaES5055 Pepper.v.1.5.chr02 159106335 1e-114
CaES3704 Pepper.v.1.5.chr02 159172752 1e-119
CaES3029 Pepper.v.1.5.chr02 159174342 1e-141
CaES0601 Pepper.v.1.5.chr02 159202713 1e-136
CaES2193 Pepper.v.1.5.chr02 159410893 1e-111
CaES4873 Pepper.v.1.5.chr02 159499333 1e-125
CaES4982 Pepper.v.1.5.chr02 159536133 1e-117
CaES3219 Pepper.v.1.5.chr02 159620485 5e-85
CaES3422 Pepper.v.1.5.chr02 159766264 1e-124
CaES1770 Pepper.v.1.5.chr02 159798898 2e-50
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549


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