Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1249 Pepper.v.1.5.chr02 140866253 1e-93
CaES2949 Pepper.v.1.5.chr02 140913903 1e-101
CaES2794 Pepper.v.1.5.chr02 141190200 1e-145
CaES2035 Pepper.v.1.5.chr02 141327234 1e-106
CaES0428 Pepper.v.1.5.chr02 141433244 8e-82
CaES0142 Pepper.v.1.5.chr02 141480349 1e-102
CaES2349 Pepper.v.1.5.chr02 141482464 1e-87
CaES4316 Pepper.v.1.5.chr02 141515030 1e-106
CaES0887 Pepper.v.1.5.chr02 141515556 1e-133
CaES5540 Pepper.v.1.5.chr02 141528774 5e-70
CaES5071 Pepper.v.1.5.chr02 141539847 1e-133
CaES2607 Pepper.v.1.5.chr02 141560622 1e-91
CaES2203 Pepper.v.1.5.chr02 141570825 1e-23
CaES4321 Pepper.v.1.5.chr02 141588043 1e-128
CaES5282 Pepper.v.1.5.chr02 141611844 1e-117
CaES2047 Pepper.v.1.5.chr02 141912019 1e-30
CaES1637 Pepper.v.1.5.chr02 141912224 2e-95
CaES0267 Pepper.v.1.5.chr02 141923614 2e-95
CaES3044 Pepper.v.1.5.chr02 141949135 1e-144
CaES1801 Pepper.v.1.5.chr02 142010870 1e-121
CaES1781 Pepper.v.1.5.chr02 142093581 3e-29
CaES0496 Pepper.v.1.5.chr02 142279513 3e-33
CaES5553 Pepper.v.1.5.chr02 142280586 3e-51
CaES4659 Pepper.v.1.5.chr02 142323583 1e-124
CaES5340 Pepper.v.1.5.chr02 142628340 1e-106
CaES2417 Pepper.v.1.5.chr02 142756441 2e-50
CaES0254 Pepper.v.1.5.chr02 143044559 2e-81
CaES1748 Pepper.v.1.5.chr02 143175223 1e-135
CaES1336 Pepper.v.1.5.chr02 143180609 1e-94
CaES2594 Pepper.v.1.5.chr02 143313112 1e-138
CaES2235 Pepper.v.1.5.chr02 143397953 1e-136
CaES2435 Pepper.v.1.5.chr02 144003277 1e-100
CaES4216 Pepper.v.1.5.chr02 144093868 2e-56
CaES1246 Pepper.v.1.5.chr02 144147711 1e-143
CaES2103 Pepper.v.1.5.chr02 144147744 1e-130
CaES4315 Pepper.v.1.5.chr02 144362998 1e-109
CaES4944 Pepper.v.1.5.chr02 144847378 5e-92
CaES0827 Pepper.v.1.5.chr02 144985407 2e-84
CaES5061 Pepper.v.1.5.chr02 145252456 1e-108
CaES4401 Pepper.v.1.5.chr02 145266037 2e-82
CaES0313 Pepper.v.1.5.chr02 145322114 1e-117
CaES0583 Pepper.v.1.5.chr02 145387730 1e-137
CaES0159 Pepper.v.1.5.chr02 145818079 6e-79
CaES4086 Pepper.v.1.5.chr02 145853998 1e-137
CaES2272 Pepper.v.1.5.chr02 145938827 1e-82
CaES5562 Pepper.v.1.5.chr02 146159733 2e-56
CaES1749 Pepper.v.1.5.chr02 146167588 1e-106
CaES0472 Pepper.v.1.5.chr02 146189016 1e-59
CaES0166 Pepper.v.1.5.chr02 146250469 4e-42
CaES2016 Pepper.v.1.5.chr02 146434262 2e-49
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549


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