Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3046 Pepper.v.1.5.chr02 163463431 1e-110
CaES4268 Pepper.v.1.5.chr02 163463743 1e-133
CaES5264 Pepper.v.1.5.chr02 163464382 6e-95
CaES3733 Pepper.v.1.5.chr02 163548470 2e-98
CaES3638 Pepper.v.1.5.chr02 163589923 4e-82
CaES3354 Pepper.v.1.5.chr02 163591382 1e-138
CaES1479 Pepper.v.1.5.chr02 163594642 5e-64
CaES2809 Pepper.v.1.5.chr02 163771537 3e-58
CaES4942 Pepper.v.1.5.chr02 163778238 6e-89
CaES2928 Pepper.v.1.5.chr02 163783574 1e-151
CaES2499 Pepper.v.1.5.chr02 163821007 3e-59
CaES4159 Pepper.v.1.5.chr02 163972125 1e-126
CaES4350 Pepper.v.1.5.chr02 163987947 1e-128
CaES3960 Pepper.v.1.5.chr02 164004339 5e-99
CaES2510 Pepper.v.1.5.chr02 164004399 3e-37
CaES1638 Pepper.v.1.5.chr02 164190200 9e-24
CaES5704 Pepper.v.1.5.chr02 164248022 2e-87
CaES3787 Pepper.v.1.5.chr02 164306846 1e-51
CaES2544 Pepper.v.1.5.chr02 164306975 4e-84
CaES3014 Pepper.v.1.5.chr02 164462073 1e-118
CaES5598 Pepper.v.1.5.chr02 164475985 2e-84
CaES3783 Pepper.v.1.5.chr02 164514674 2e-68
CaES2742 Pepper.v.1.5.chr02 164529632 2e-46
CaES2037 Pepper.v.1.5.chr02 164533128 1e-60
CaES1218 Pepper.v.1.5.chr02 164545220 4e-41
CaES0970 Pepper.v.1.5.chr02 164566168 1e-129
CaES0537 Pepper.v.1.5.chr02 164578802 1e-115
CaES4639 Pepper.v.1.5.chr02 164599066 1e-136
CaES0586 Pepper.v.1.5.chr02 164724649 1e-145
CaES4472 Pepper.v.1.5.chr02 164782264 1e-117
CaES4295 Pepper.v.1.5.chr02 164822904 1e-127
CaES4048 Pepper.v.1.5.chr02 164887205 2e-68
CaES4524 Pepper.v.1.5.chr02 165033805 1e-146
CaES2664 Pepper.v.1.5.chr02 165083371 5e-99
CaES4516 Pepper.v.1.5.chr02 165168019 1e-132
CaES0801 Pepper.v.1.5.chr02 165224612 1e-139
CaES3895 Pepper.v.1.5.chr02 165354269 1e-114
CaES5469 Pepper.v.1.5.chr02 165362193 7e-80
CaES1675 Pepper.v.1.5.chr02 165557635 1e-111
CaES5703 Pepper.v.1.5.chr02 165597908 1e-86
CaES4012 Pepper.v.1.5.chr02 165599762 9e-43
CaES3578 Pepper.v.1.5.chr02 165716872 5e-76
CaES0859 Pepper.v.1.5.chr02 165732074 1e-107
CaES0727 Pepper.v.1.5.chr02 165790238 1e-118
CaES1131 Pepper.v.1.5.chr02 165822048 1e-117
CaES3837 Pepper.v.1.5.chr02 165884485 8e-83
CaES2285 Pepper.v.1.5.chr02 165885358 7e-83
CaES3666 Pepper.v.1.5.chr02 165885625 1e-160
CaES5555 Pepper.v.1.5.chr02 166099474 5e-53
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549


MarkerDB | Capsicum annuum