Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1926 Pepper.v.1.5.chr07 215670660 1e-115
CaES0265 Pepper.v.1.5.chr07 215803271 1e-37
CaES0423 Pepper.v.1.5.chr07 215926337 1e-136
CaES0842 Pepper.v.1.5.chr07 216238409 5e-52
CaES4679 Pepper.v.1.5.chr07 216396369 5e-66
CaES4739 Pepper.v.1.5.chr07 216396369 6e-40
CaES2295 Pepper.v.1.5.chr07 216495537 5e-94
CaES1364 Pepper.v.1.5.chr07 216564363 4e-80
CaES2102 Pepper.v.1.5.chr07 216564363 2e-67
CaES4017 Pepper.v.1.5.chr07 217044686 1e-119
CaES0150 Pepper.v.1.5.chr07 217166050 1e-25
CaES0206 Pepper.v.1.5.chr07 217175382 1e-100
CaES3047 Pepper.v.1.5.chr07 217179209 1e-64
CaES4871 Pepper.v.1.5.chr07 217302536 1e-110
CaES4519 Pepper.v.1.5.chr07 217391723 1e-135
CaES4093 Pepper.v.1.5.chr07 217392127 2e-22
CaES3699 Pepper.v.1.5.chr07 217490100 2e-56
CaES0352 Pepper.v.1.5.chr07 217837490 1e-139
CaES2479 Pepper.v.1.5.chr07 218023210 2e-66
CaES4927 Pepper.v.1.5.chr07 218166086 1e-105
CaES4470 Pepper.v.1.5.chr07 218167155 1e-106
CaES4722 Pepper.v.1.5.chr07 218220175 1e-163
CaES2856 Pepper.v.1.5.chr07 218886665 1e-153
CaES5229 Pepper.v.1.5.chr07 218952779 1e-124
CaES3850 Pepper.v.1.5.chr07 218997131 1e-110
CaES2721 Pepper.v.1.5.chr07 219190011 1e-112
CaES1659 Pepper.v.1.5.chr07 219229870 1e-154
CaES4473 Pepper.v.1.5.chr07 219307676 4e-21
CaES2320 Pepper.v.1.5.chr07 219408723 1e-126
CaES3530 Pepper.v.1.5.chr07 219460146 1e-125
CaES5258 Pepper.v.1.5.chr07 219612165 4e-90
CaES3553 Pepper.v.1.5.chr07 219649614 1e-78
CaES3744 Pepper.v.1.5.chr07 219773370 1e-121
CaES4357 Pepper.v.1.5.chr07 219846706 7e-87
CaES2413 Pepper.v.1.5.chr07 220017268 2e-71
CaES0058 Pepper.v.1.5.chr07 220032106 2e-80
CaES1006 Pepper.v.1.5.chr07 220158220 1e-119
CaES5319 Pepper.v.1.5.chr07 220357075 8e-42
CaES0971 Pepper.v.1.5.chr07 220430022 1e-132
CaES2583 Pepper.v.1.5.chr07 220555465 1e-119
CaES4074 Pepper.v.1.5.chr07 220649101 1e-108
CaES0393 Pepper.v.1.5.chr07 220779344 6e-92
CaES2194 Pepper.v.1.5.chr07 220885318 1e-102
CaES3289 Pepper.v.1.5.chr07 220915687 2e-93
CaES4431 Pepper.v.1.5.chr07 220919751 1e-132
CaES5592 Pepper.v.1.5.chr07 220926751 1e-88
CaES4310 Pepper.v.1.5.chr07 220935636 1e-148
CaES4264 Pepper.v.1.5.chr07 221050638 1e-118
CaES0546 Pepper.v.1.5.chr07 221120169 1e-100
CaES4856 Pepper.v.1.5.chr07 221230828 5e-98
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409


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