Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0503 Pepper.v.1.5.chr07 101582943 3e-74
CaES2092 Pepper.v.1.5.chr07 108142646 1e-146
CaES0936 Pepper.v.1.5.chr07 108143439 1e-131
CaES3856 0.0 78 Pepper.v.1.5.chr07 110274798 5e-93
CaES4303 Pepper.v.1.5.chr07 111411817 9e-35
CaES5247 Pepper.v.1.5.chr07 111412075 1e-133
CaES2040 Pepper.v.1.5.chr07 111425586 1e-106
CaES5367 Pepper.v.1.5.chr07 112662336 2e-94
CaES3912 Pepper.v.1.5.chr07 113341440 4e-67
CaES1854 Pepper.v.1.5.chr07 115700884 1e-122
CaES2858 Pepper.v.1.5.chr07 115709250 1e-110
CaES4440 Pepper.v.1.5.chr07 116801410 1e-112
CaES3090 Pepper.v.1.5.chr07 117702173 1e-128
CaES5565 Pepper.v.1.5.chr07 117967430 1e-100
CaES3396 Pepper.v.1.5.chr07 119268526 1e-119
CaES4286 Pepper.v.1.5.chr07 119278890 1e-138
CaES0165 Pepper.v.1.5.chr07 119770732 8e-58
CaES1680 Pepper.v.1.5.chr07 120186020 1e-92
CaES4370 Pepper.v.1.5.chr07 120193746 2e-60
CaES4731 Pepper.v.1.5.chr07 120203698 2e-79
CaES0896 Pepper.v.1.5.chr07 120916152 1e-108
CaES3698 Pepper.v.1.5.chr07 121048447 8e-62
CaES1300 Pepper.v.1.5.chr07 121868989 1e-116
CaES3661 Pepper.v.1.5.chr07 122218980 1e-129
CaES3132 Pepper.v.1.5.chr07 122346342 8e-55
CaES3948 Pepper.v.1.5.chr07 122825696 2e-97
CaES3580 Pepper.v.1.5.chr07 123678615 2e-29
CaES1312 Pepper.v.1.5.chr07 124790813 1e-138
CaES1625 Pepper.v.1.5.chr07 124874095 5e-53
CaES3985 Pepper.v.1.5.chr07 125386505 1e-122
CaES3211 Pepper.v.1.5.chr07 125810717 1e-126
CaES4485 Pepper.v.1.5.chr07 127594991 1e-107
CaES4028 Pepper.v.1.5.chr07 127612719 1e-124
CaES1813 Pepper.v.1.5.chr07 128538541 1e-146
CaES2722 Pepper.v.1.5.chr07 128783976 1e-138
CaES1032 Pepper.v.1.5.chr07 135487647 2e-98
CaES2342 Pepper.v.1.5.chr07 136767198 3e-56
CaES3934 Pepper.v.1.5.chr07 136767198 2e-36
CaES2244 Pepper.v.1.5.chr07 136767303 3e-33
CaES3388 Pepper.v.1.5.chr07 137183185 1e-107
CaES1036 Pepper.v.1.5.chr07 137931849 1e-124
CaES4833 Pepper.v.1.5.chr07 139982835 1e-119
CaES2753 Pepper.v.1.5.chr07 144683991 1e-142
CaES0228 Pepper.v.1.5.chr07 145068550 1e-112
CaES0182 Pepper.v.1.5.chr07 145069042 1e-116
CaES2300 Pepper.v.1.5.chr07 145205541 1e-158
CaES2601 Pepper.v.1.5.chr07 149058412 4e-91
CaES5657 Pepper.v.1.5.chr07 149774606 1e-111
CaES4280 Pepper.v.1.5.chr07 150027577 1e-147
CaES2790 0.339 183 Pepper.v.1.5.chr07 151250398 1e-103
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

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