Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4451 Pepper.v.1.5.chr07 154258497 1e-118
CaES0681 Pepper.v.1.5.chr07 156872323 7e-25
CaES3366 Pepper.v.1.5.chr07 161243410 2e-58
CaES1136 Pepper.v.1.5.chr07 165060315 1e-141
CaES3997 Pepper.v.1.5.chr07 169525445 1e-143
CaES4839 Pepper.v.1.5.chr07 169628199 2e-52
CaES2724 Pepper.v.1.5.chr07 171174261 9e-81
CaES4874 Pepper.v.1.5.chr07 172683033 1e-109
CaES2446 Pepper.v.1.5.chr07 173298507 2e-54
CaES0017 Pepper.v.1.5.chr07 174396458 4e-29
CaES0952 Pepper.v.1.5.chr07 174641764 2e-53
CaES1803 Pepper.v.1.5.chr07 174778856 1e-120
CaES2052 Pepper.v.1.5.chr07 176254695 1e-110
CaES3221 Pepper.v.1.5.chr07 176267448 2e-81
CaES3393 Pepper.v.1.5.chr07 177039830 1e-130
CaES3011 Pepper.v.1.5.chr07 177299477 4e-72
CaES0833 Pepper.v.1.5.chr07 177355920 9e-34
CaES0750 Pepper.v.1.5.chr07 177356427 1e-133
CaES1861 Pepper.v.1.5.chr07 177855001 1e-159
CaES1188 Pepper.v.1.5.chr07 177855891 5e-91
CaES0913 Pepper.v.1.5.chr07 177962197 1e-155
CaES0674 Pepper.v.1.5.chr07 178152729 2e-94
CaES1535 Pepper.v.1.5.chr07 178391997 1e-97
CaES3253 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr07 178886468 1e-145
CaES4933 Pepper.v.1.5.chr07 179677619 1e-123
CaES5412 Pepper.v.1.5.chr07 179717614 4e-71
CaES2108 Pepper.v.1.5.chr07 180122758 1e-123
CaES1482 Pepper.v.1.5.chr07 180564742 2e-50
CaES0324 Pepper.v.1.5.chr07 180812689 1e-67
CaES4103 Pepper.v.1.5.chr07 182151055 1e-116
CaES2829 Pepper.v.1.5.chr07 183519111 1e-139
CaES4858 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr07 183735040 1e-145
CaES1464 Pepper.v.1.5.chr07 184180707 4e-94
CaES0424 Pepper.v.1.5.chr07 184185119 4e-86
CaES0826 Pepper.v.1.5.chr07 184257119 2e-71
CaES3657 Pepper.v.1.5.chr07 184428618 1e-125
CaES1442 Pepper.v.1.5.chr07 184944452 2e-31
CaES4071 Pepper.v.1.5.chr07 185258041 1e-123
CaES3652 Pepper.v.1.5.chr07 185482611 1e-24
CaES4907 Pepper.v.1.5.chr07 188019718 1e-117
CaES1572 Pepper.v.1.5.chr07 188742795 3e-64
CaES4520 Pepper.v.1.5.chr07 190883674 1e-91
CaES1585 Pepper.v.1.5.chr07 190892028 3e-67
CaES5668 Pepper.v.1.5.chr07 191904662 1e-110
CaES0257 Pepper.v.1.5.chr07 192796682 1e-55
CaES0798 Pepper.v.1.5.chr07 194176266 1e-93
CaES1599 Pepper.v.1.5.chr07 195275173 2e-89
CaES4988 Pepper.v.1.5.chr07 196819871 1e-102
CaES2402 Pepper.v.1.5.chr07 197584630 1e-84
CaES2192 Pepper.v.1.5.chr07 197671637 1e-134
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409


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