Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1258 Pepper.v.1.5.chr02 159975756 1e-110
CaES2840 Pepper.v.1.5.chr02 160058283 1e-138
CaES1087 Pepper.v.1.5.chr02 160083728 1e-138
CaES4658 Pepper.v.1.5.chr02 160086924 1e-119
CaES0635 Pepper.v.1.5.chr02 160203350 3e-91
CaES2657 Pepper.v.1.5.chr02 160230033 1e-36
CaES1816 Pepper.v.1.5.chr02 160302759 1e-110
CaES4683 Pepper.v.1.5.chr02 160303342 1e-67
CaES3496 Pepper.v.1.5.chr02 160374326 3e-97
CaES1695 Pepper.v.1.5.chr02 160456835 1e-129
CaES3568 Pepper.v.1.5.chr02 160474565 1e-127
CaES3443 Pepper.v.1.5.chr02 160673926 1e-133
CaES4137 Pepper.v.1.5.chr02 160684400 1e-127
CaES2621 Pepper.v.1.5.chr02 160767763 1e-140
CaES4186 Pepper.v.1.5.chr02 160769376 1e-130
CaES4056 Pepper.v.1.5.chr02 160777470 8e-65
CaES1913 Pepper.v.1.5.chr02 160832633 1e-119
CaES5227 Pepper.v.1.5.chr02 161152388 1e-133
CaES0380 Pepper.v.1.5.chr02 161182294 1e-124
CaES1852 Pepper.v.1.5.chr02 161478644 1e-118
CaES1501 Pepper.v.1.5.chr02 161643608 1e-114
CaES5216 Pepper.v.1.5.chr02 161643974 6e-73
CaES4490 Pepper.v.1.5.chr02 161694831 1e-109
CaES5463 Pepper.v.1.5.chr02 161739871 4e-58
CaES5506 Pepper.v.1.5.chr02 161838154 9e-82
CaES0786 Pepper.v.1.5.chr02 161860340 1e-49
CaES3468 Pepper.v.1.5.chr02 161860340 3e-67
CaES5042 Pepper.v.1.5.chr02 161914941 1e-141
CaES4027 Pepper.v.1.5.chr02 161973988 1e-130
CaES2233 Pepper.v.1.5.chr02 162216142 1e-146
CaES3286 Pepper.v.1.5.chr02 162225016 1e-112
CaES5224 Pepper.v.1.5.chr02 162438570 1e-122
CaES5232 Pepper.v.1.5.chr02 162439174 1e-118
CaES1159 Pepper.v.1.5.chr02 162445897 1e-118
CaES4314 Pepper.v.1.5.chr02 162462130 1e-149
CaES2920 0.081 191 Pepper.v.1.5.chr02 162496068 1e-125
CaES5106 Pepper.v.1.5.chr02 162642557 1e-139
CaES0184 Pepper.v.1.5.chr02 162661312 1e-103
CaES3207 Pepper.v.1.5.chr02 162684709 5e-54
CaES2136 Pepper.v.1.5.chr02 162751493 1e-147
CaES4129 Pepper.v.1.5.chr02 162864867 2e-58
CaES4939 Pepper.v.1.5.chr02 163143942 1e-100
CaES3382 Pepper.v.1.5.chr02 163150001 1e-151
CaES5530 Pepper.v.1.5.chr02 163203155 6e-31
CaES4087 Pepper.v.1.5.chr02 163204520 1e-145
CaES5440 Pepper.v.1.5.chr02 163204520 1e-79
CaES2541 Pepper.v.1.5.chr02 163262354 2e-82
CaES2506 Pepper.v.1.5.chr02 163267374 2e-89
CaES5464 Pepper.v.1.5.chr02 163280214 1e-37
CaES1737 Pepper.v.1.5.chr02 163295956 9e-64
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549


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