Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2421 Pepper.v.1.5.chr02 42641305 2e-80
CaES4794 Pepper.v.1.5.chr02 46401665 1e-125
CaES1824 Pepper.v.1.5.chr02 46684172 1e-104
CaES1252 Pepper.v.1.5.chr02 46697685 8e-62
CaES1112 0.499 190 Pepper.v.1.5.chr02 48575080 2e-72
CaES3974 Pepper.v.1.5.chr02 49799882 1e-115
CaES3385 Pepper.v.1.5.chr02 52238312 1e-119
CaES1415 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr02 52333354 1e-128
CaES5667 Pepper.v.1.5.chr02 52880022 2e-71
CaES1553 Pepper.v.1.5.chr02 52882127 9e-26
CaES5352 Pepper.v.1.5.chr02 53378825 1e-105
CaES2585 Pepper.v.1.5.chr02 54847421 1e-59
CaES1867 Pepper.v.1.5.chr02 56298217 1e-116
CaES2390 Pepper.v.1.5.chr02 58587041 6e-47
CaES2406 Pepper.v.1.5.chr02 60081366 4e-98
CaES0640 Pepper.v.1.5.chr02 60081629 7e-48
CaES1818 Pepper.v.1.5.chr02 60179284 1e-148
CaES4774 Pepper.v.1.5.chr02 60180840 4e-95
CaES2846 Pepper.v.1.5.chr02 60400846 1e-120
CaES0806 Pepper.v.1.5.chr02 60563487 1e-132
CaES5024 0.0 180 Pepper.v.1.5.chr02 60620341 1e-150
CaES1920 Pepper.v.1.5.chr02 60777377 1e-124
CaES4160 Pepper.v.1.5.chr02 60788041 3e-66
CaES4213 Pepper.v.1.5.chr02 62626379 6e-82
CaES0317 Pepper.v.1.5.chr02 62768050 1e-145
CaES2311 Pepper.v.1.5.chr02 63292602 1e-119
CaES2911 Pepper.v.1.5.chr02 63294172 1e-129
CaES5626 Pepper.v.1.5.chr02 63678423 4e-74
CaES3984 Pepper.v.1.5.chr02 67303077 5e-86
CaES0215 Pepper.v.1.5.chr02 67353199 8e-26
CaES1137 0.236 190 Pepper.v.1.5.chr02 67587845 6e-83
CaES5709 Pepper.v.1.5.chr02 70356223 1e-120
CaES1885 Pepper.v.1.5.chr02 70709670 5e-69
CaES3977 Pepper.v.1.5.chr02 70731440 1e-93
CaES4572 Pepper.v.1.5.chr02 70771160 2e-74
CaES4257 Pepper.v.1.5.chr02 71177471 1e-115
CaES1740 Pepper.v.1.5.chr02 71937590 4e-52
CaES2343 Pepper.v.1.5.chr02 71937698 5e-39
CaES1037 Pepper.v.1.5.chr02 73116747 4e-47
CaES0251 Pepper.v.1.5.chr02 73184915 4e-61
CaES3762 Pepper.v.1.5.chr02 76536303 4e-24
CaES5139 Pepper.v.1.5.chr02 77056245 1e-135
CaES4195 Pepper.v.1.5.chr02 77056668 2e-28
CaES5418 Pepper.v.1.5.chr02 77462863 4e-50
CaES3849 Pepper.v.1.5.chr02 77462863 1e-117
CaES0908 Pepper.v.1.5.chr02 79404284 5e-99
CaES4879 Pepper.v.1.5.chr02 82554948 1e-129
CaES2064 Pepper.v.1.5.chr02 82762802 3e-51
CaES2811 Pepper.v.1.5.chr02 84489954 7e-68
CaES2907 Pepper.v.1.5.chr02 84659647 6e-68
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549


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