Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr02

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 549


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4354 Pepper.v.1.5.chr02 151771758 2e-97
CaES2718 Pepper.v.1.5.chr02 151772453 1e-140
CaES0386 Pepper.v.1.5.chr02 151816063 1e-117
CaES4799 Pepper.v.1.5.chr02 152215413 2e-70
CaES2695 Pepper.v.1.5.chr02 152272367 1e-118
CaES4902 Pepper.v.1.5.chr02 152276132 1e-145
CaES4007 Pepper.v.1.5.chr02 152318289 1e-115
CaES0123 Pepper.v.1.5.chr02 152318974 6e-92
CaES2346 Pepper.v.1.5.chr02 152616904 1e-102
CaES1339 Pepper.v.1.5.chr02 152640826 2e-90
CaES3941 Pepper.v.1.5.chr02 152695483 8e-84
CaES4947 Pepper.v.1.5.chr02 152724312 5e-57
CaES1755 Pepper.v.1.5.chr02 152737018 2e-72
CaES0053 Pepper.v.1.5.chr02 152827631 1e-121
CaES0170 Pepper.v.1.5.chr02 152834527 1e-45
CaES3978 Pepper.v.1.5.chr02 152847126 1e-169
CaES3424 Pepper.v.1.5.chr02 152861487 1e-110
CaES2898 Pepper.v.1.5.chr02 153089727 1e-130
CaES1511 Pepper.v.1.5.chr02 153090100 1e-124
CaES1743 Pepper.v.1.5.chr02 153284145 3e-25
CaES2711 Pepper.v.1.5.chr02 153286029 1e-142
CaES1692 Pepper.v.1.5.chr02 153602743 4e-70
CaES3444 Pepper.v.1.5.chr02 153643132 1e-145
CaES2839 Pepper.v.1.5.chr02 153824107 1e-133
CaES2561 Pepper.v.1.5.chr02 153878489 1e-123
CaES3708 Pepper.v.1.5.chr02 153938586 1e-117
CaES3780 Pepper.v.1.5.chr02 154025545 1e-132
CaES5429 Pepper.v.1.5.chr02 154025922 6e-95
CaES2489 0.005 192 Pepper.v.1.5.chr02 154045458 1e-58
CaES5342 Pepper.v.1.5.chr02 154057205 9e-36
CaES0578 Pepper.v.1.5.chr02 154057349 3e-63
CaES4893 Pepper.v.1.5.chr02 154057430 4e-29
CaES5115 Pepper.v.1.5.chr02 154387732 1e-104
CaES2000 Pepper.v.1.5.chr02 154391899 2e-83
CaES3087 Pepper.v.1.5.chr02 154411913 1e-137
CaES2411 Pepper.v.1.5.chr02 154413159 5e-87
CaES2304 Pepper.v.1.5.chr02 154597426 1e-83
CaES5347 Pepper.v.1.5.chr02 154631750 2e-21
CaES2164 Pepper.v.1.5.chr02 154696387 4e-85
CaES3805 Pepper.v.1.5.chr02 154901324 1e-112
CaES1746 Pepper.v.1.5.chr02 155025023 2e-52
CaES5499 Pepper.v.1.5.chr02 155207494 1e-42
CaES3854 Pepper.v.1.5.chr02 155233747 1e-128
CaES2003 Pepper.v.1.5.chr02 155383231 4e-75
CaES5176 Pepper.v.1.5.chr02 155421514 7e-73
CaES0430 Pepper.v.1.5.chr02 155445757 1e-127
CaES4406 Pepper.v.1.5.chr02 155464879 1e-154
CaES4742 Pepper.v.1.5.chr02 155488117 2e-55
CaES3254 Pepper.v.1.5.chr02 155532864 1e-110
CaES4689 Pepper.v.1.5.chr02 155697938 1e-113
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 549


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