Solanum lycopersicum
Genome List : [SL2.40] SL2.40ch08
Order of markers and gene models
Markers on the genome
Total Entries: 1958
| Marker | Genome sort (SL2.40) |
e-value | Expen2000 sort | AMF2 sort | MMF2 sort | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Name sort | Type | Name | Position (*) | Linkage | Position | Linkage | Position | Linkage | Position | |
| TES0668 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 24476 | 0.0 | ||||||
| TES2323 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 24476 | 0.0 | ||||||
| TES2050 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 24480 | 0.0 | ||||||
| TES2226 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 34367 | 0.0 | ||||||
| 8062_285 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 35423 | 0.0 | ||||||
| 15653_318 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 51135 | 0.0 | ||||||
| cLEN9M1 | unknown | SL2.40ch08 | 53348 | 1e-142 | ch08 | 2.763 | ||||
| TGS10569 | Genome-SSR | SL2.40ch08 | 73837 | 0.0 | ||||||
| TGS12076 | Genome-SSR | SL2.40ch08 | 75369 | 0.0 | ||||||
| TES2549 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 78374 | 1e-149 | ||||||
| TGS2862 | Genome-SSR | SL2.40ch08 | 86363 | 0.0 | ||||||
| TGS8983 | Genome-SSR | SL2.40ch08 | 88953 | 0.0 | ||||||
| TGS1246 | Genome-SSR | SL2.40ch08 | 94213 | 0.0 | ||||||
| cLEF51A13 | unknown | SL2.40ch08 | 96826 | 1e-110 | ch08 | 2.871 | ||||
| TGS9974 | Genome-SSR | SL2.40ch08 | 106498 | 0.0 | ||||||
| TES3266 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 116833 | 0.0 | ||||||
| TES0905 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 129946 | 0.0 | ||||||
| TES5154 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 143480 | 0.0 | ||||||
| TES4758 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 179113 | 1e-128 | ||||||
| TGS7533 | Genome-SSR | SL2.40ch08 | 186132 | 0.0 | ||||||
| TES0913 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 201839 | 4e-48 | ||||||
| TES6104 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 227905 | 1e-145 | ||||||
| TES2637 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 236340 | 0.0 | ||||||
| TGS4664 | Genome-SSR | SL2.40ch08 | 236610 | 0.0 | ||||||
| TES2853 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 292704 | 0.0 | ||||||
| TGS5253 | Genome-SSR | SL2.40ch08 | 292848 | 0.0 | ||||||
| TGS12704 | Genome-SSR | SL2.40ch08 | 308138 | 0.0 | ||||||
| TES1604 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 331726 | 0.0 | ||||||
| TES3086 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 352275 | 0.0 | ||||||
| TES3922 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 364989 | 1e-165 | ||||||
| TES3496 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 374643 | 0.0 | ||||||
| TGS8434 | Genome-SSR | SL2.40ch08 | 374755 | 0.0 | ||||||
| TES0948 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 408357 | 0.0 | ch08 | 2.091 | ||||
| TES6236 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 415939 | 0.0 | ||||||
| TES1948 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 419779 | 0.0 | ||||||
| TES4696 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 424204 | 0.0 | ||||||
| TES7492 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 477432 | 0.0 | ||||||
| TES6447 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 556930 | 0.0 | ||||||
| 10489_192 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 560085 | 0.0 | ch08 | 0.000 | ch08 | 0.000 | ||
| 10489_245 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 560085 | 0.0 | ||||||
| TES4520 | EST-SSR | SL2.40ch08 | 565889 | 0.0 | ||||||
| 15910_157 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 585773 | 1e-129 | ||||||
| 15910_212 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 585773 | 1e-129 | ||||||
| 15910_267 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 585773 | 1e-129 | ||||||
| 15910_300 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 585773 | 1e-129 | ||||||
| 15910_349 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 585773 | 1e-129 | ||||||
| 15910_427 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 585773 | 1e-129 | ||||||
| 15910_522 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 585773 | 1e-129 | ||||||
| 15910_546 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 585773 | 1e-129 | ||||||
| 18065_277 | EST-SNP | SL2.40ch08 | 586095 | 0.0 | ch08 | 0.430 | ch08 | 0.000 | ||
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using blastn without filtering query sequence.