Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr08

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 273


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2024 Pepper.v.1.5.chr08 38179424 1e-138
CaES2604 Pepper.v.1.5.chr08 38179952 1e-142
CaES3540 Pepper.v.1.5.chr08 38188752 1e-102
CaES4677 Pepper.v.1.5.chr08 41988515 1e-134
CaES1517 Pepper.v.1.5.chr08 43480485 9e-67
CaES5296 Pepper.v.1.5.chr08 43480696 2e-90
CaES2460 Pepper.v.1.5.chr08 45152390 9e-96
CaES4625 Pepper.v.1.5.chr08 45335015 1e-107
CaES2028 Pepper.v.1.5.chr08 46954445 1e-129
CaES3612 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr08 46954912 1e-162
CaES2645 Pepper.v.1.5.chr08 50028534 1e-103
CaES3434 Pepper.v.1.5.chr08 51085583 2e-49
CaES2217 Pepper.v.1.5.chr08 51154777 1e-74
CaES1019 Pepper.v.1.5.chr08 51154777 3e-44
CaES0860 Pepper.v.1.5.chr08 51677998 1e-76
CaES3640 Pepper.v.1.5.chr08 52179783 5e-83
CaES2267 Pepper.v.1.5.chr08 52180341 1e-125
CaES5157 Pepper.v.1.5.chr08 52372359 5e-49
CaES2577 Pepper.v.1.5.chr08 52378736 1e-111
CaES1129 Pepper.v.1.5.chr08 53315716 1e-133
CaES4390 Pepper.v.1.5.chr08 55075717 4e-83
CaES3539 Pepper.v.1.5.chr08 55181782 8e-75
CaES2555 Pepper.v.1.5.chr08 59024118 1e-117
CaES1689 Pepper.v.1.5.chr08 59024818 1e-91
CaES3146 Pepper.v.1.5.chr08 59535955 1e-105
CaES5332 Pepper.v.1.5.chr08 61898199 2e-22
CaES0219 Pepper.v.1.5.chr08 62571176 1e-85
CaES4042 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr08 63818171 1e-126
CaES2238 Pepper.v.1.5.chr08 64484078 1e-43
CaES3527 Pepper.v.1.5.chr08 65445541 1e-115
CaES1183 Pepper.v.1.5.chr08 65445541 1e-119
CaES5344 Pepper.v.1.5.chr08 65448035 5e-82
CaES3926 Pepper.v.1.5.chr08 66078893 1e-112
CaES3848 Pepper.v.1.5.chr08 71513578 1e-110
CaES4174 Pepper.v.1.5.chr08 71857225 1e-112
CaES4700 Pepper.v.1.5.chr08 72221734 2e-56
CaES1352 Pepper.v.1.5.chr08 72222337 1e-133
CaES1283 Pepper.v.1.5.chr08 73295604 3e-96
CaES1702 Pepper.v.1.5.chr08 74689245 4e-37
CaES4410 0.498 191 Pepper.v.1.5.chr08 78590091 1e-111
CaES3797 Pepper.v.1.5.chr08 79515021 1e-120
CaES0813 Pepper.v.1.5.chr08 81165030 1e-110
CaES0167 Pepper.v.1.5.chr08 85089136 4e-43
CaES4505 Pepper.v.1.5.chr08 85283620 1e-105
CaES2068 Pepper.v.1.5.chr08 85403942 1e-132
CaES5079 Pepper.v.1.5.chr08 85794649 1e-114
CaES4260 Pepper.v.1.5.chr08 85802258 1e-109
CaES0162 Pepper.v.1.5.chr08 86228946 1e-140
CaES4957 Pepper.v.1.5.chr08 86229669 1e-37
CaES4596 Pepper.v.1.5.chr08 87708924 2e-81
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 273


MarkerDB | Capsicum annuum