Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES2788 Pepper.v.1.5.chr07 94776 1e-140
CaES4029 Pepper.v.1.5.chr07 98423 1e-74
CaES0538 Pepper.v.1.5.chr07 106388 1e-81
CaES1309 Pepper.v.1.5.chr07 153761 6e-63
CaES0271 Pepper.v.1.5.chr07 166183 3e-75
CaES3963 Pepper.v.1.5.chr07 171590 1e-82
CaES5356 Pepper.v.1.5.chr07 322024 1e-107
CaES0126 Pepper.v.1.5.chr07 430146 2e-64
CaES1473 Pepper.v.1.5.chr07 666499 6e-88
CaES3180 Pepper.v.1.5.chr07 666577 7e-71
CaES3200 Pepper.v.1.5.chr07 666818 2e-61
CaES0594 Pepper.v.1.5.chr07 698242 7e-61
CaES4025 Pepper.v.1.5.chr07 698921 3e-67
CaES0550 Pepper.v.1.5.chr07 740244 1e-141
CaES0698 Pepper.v.1.5.chr07 814219 1e-125
CaES2883 Pepper.v.1.5.chr07 891839 1e-126
CaES4746 Pepper.v.1.5.chr07 892917 3e-51
CaES2160 Pepper.v.1.5.chr07 1255351 4e-94
CaES3764 Pepper.v.1.5.chr07 1314174 1e-121
CaES1845 Pepper.v.1.5.chr07 1791955 4e-69
CaES5156 Pepper.v.1.5.chr07 2057023 8e-97
CaES4163 Pepper.v.1.5.chr07 2100873 1e-99
CaES2884 Pepper.v.1.5.chr07 2352926 1e-107
CaES3536 Pepper.v.1.5.chr07 2395375 1e-121
CaES4675 Pepper.v.1.5.chr07 2411248 1e-127
CaES2467 Pepper.v.1.5.chr07 2428229 4e-96
CaES0597 Pepper.v.1.5.chr07 2612020 1e-125
CaES2257 Pepper.v.1.5.chr07 2619479 4e-27
CaES4089 Pepper.v.1.5.chr07 2631751 2e-70
CaES4775 Pepper.v.1.5.chr07 3550235 1e-127
CaES0507 Pepper.v.1.5.chr07 3867457 3e-73
CaES0235 Pepper.v.1.5.chr07 3893078 4e-44
CaES3183 Pepper.v.1.5.chr07 4011946 2e-33
CaES1506 Pepper.v.1.5.chr07 4065184 5e-95
CaES2592 Pepper.v.1.5.chr07 5322522 5e-75
CaES2324 Pepper.v.1.5.chr07 5327723 1e-110
CaES0992 Pepper.v.1.5.chr07 5567872 2e-33
CaES0944 Pepper.v.1.5.chr07 5639049 1e-124
CaES0869 Pepper.v.1.5.chr07 5645762 1e-106
CaES5738 Pepper.v.1.5.chr07 5654523 7e-60
CaES0755 Pepper.v.1.5.chr07 5663572 1e-120
CaES2123 Pepper.v.1.5.chr07 5683812 7e-49
CaES2252 0.011 187 Pepper.v.1.5.chr07 5740142 1e-127
CaES5262 Pepper.v.1.5.chr07 5913273 3e-36
CaES3017 Pepper.v.1.5.chr07 5979144 4e-36
CaES0773 Pepper.v.1.5.chr07 6157202 4e-60
CaES2031 Pepper.v.1.5.chr07 6247570 1e-123
CaES2624 Pepper.v.1.5.chr07 6920174 1e-134
CaES4004 Pepper.v.1.5.chr07 7352964 1e-146
CaES0920 Pepper.v.1.5.chr07 7514630 1e-129
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409

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