Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr11

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 302


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES2674 Pepper.v.1.5.chr11 183468922 2e-49
CaES4648 Pepper.v.1.5.chr11 183469897 5e-42
CaES4166 Pepper.v.1.5.chr11 183649577 1e-81
CaES2339 Pepper.v.1.5.chr11 187169422 6e-76
CaES3294 Pepper.v.1.5.chr11 187254087 4e-60
CaES2249 Pepper.v.1.5.chr11 189487205 4e-37
CaES0624 Pepper.v.1.5.chr11 189653078 1e-70
CaES1194 Pepper.v.1.5.chr11 189653078 1e-73
CaES3456 Pepper.v.1.5.chr11 189654397 1e-136
CaES0062 Pepper.v.1.5.chr11 197762381 1e-119
CaES1247 Pepper.v.1.5.chr11 199317473 3e-59
CaES0195 Pepper.v.1.5.chr11 202226079 1e-118
CaES4151 Pepper.v.1.5.chr11 203882316 1e-134
CaES3462 Pepper.v.1.5.chr11 203995393 1e-102
CaES1049 Pepper.v.1.5.chr11 204449928 1e-125
CaES5449 Pepper.v.1.5.chr11 204768795 3e-66
CaES0621 Pepper.v.1.5.chr11 204794156 1e-153
CaES2205 Pepper.v.1.5.chr11 206843781 6e-88
CaES2977 Pepper.v.1.5.chr11 206843797 1e-138
CaES4242 Pepper.v.1.5.chr11 206845098 2e-85
CaES2142 Pepper.v.1.5.chr11 207751498 1e-141
CaES4640 Pepper.v.1.5.chr11 209749339 3e-66
CaES3205 Pepper.v.1.5.chr11 210936100 1e-41
CaES2322 Pepper.v.1.5.chr11 211650206 1e-111
CaES0972 Pepper.v.1.5.chr11 212414612 1e-121
CaES4896 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr11 213066052 1e-104
CaES1404 Pepper.v.1.5.chr11 213542979 3e-72
CaES0978 Pepper.v.1.5.chr11 215702221 1e-152
CaES5664 Pepper.v.1.5.chr11 216512411 3e-45
CaES2107 Pepper.v.1.5.chr11 216634781 1e-111
CaES3559 Pepper.v.1.5.chr11 216634988 3e-76
CaES0061 Pepper.v.1.5.chr11 216715059 4e-91
CaES3725 Pepper.v.1.5.chr11 218396198 1e-116
CaES3792 Pepper.v.1.5.chr11 221245634 8e-71
CaES1588 Pepper.v.1.5.chr11 221631492 4e-90
CaES4001 Pepper.v.1.5.chr11 221849760 1e-131
CaES5054 Pepper.v.1.5.chr11 221852310 1e-144
CaES2133 Pepper.v.1.5.chr11 223489677 1e-83
CaES1432 Pepper.v.1.5.chr11 223571944 2e-89
CaES1596 Pepper.v.1.5.chr11 223630093 9e-66
CaES1262 Pepper.v.1.5.chr11 223974099 5e-74
CaES0043 Pepper.v.1.5.chr11 224886678 1e-102
CaES1606 Pepper.v.1.5.chr11 224916983 1e-110
CaES3162 Pepper.v.1.5.chr11 224941096 2e-27
CaES4976 Pepper.v.1.5.chr11 225026764 1e-106
CaES5607 Pepper.v.1.5.chr11 227643501 3e-36
CaES0153 Pepper.v.1.5.chr11 228812481 1e-70
CaES3323 Pepper.v.1.5.chr11 228812628 4e-73
CaES2246 Pepper.v.1.5.chr11 229742172 1e-133
CaES1105 Pepper.v.1.5.chr11 229951630 1e-104
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 302

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