Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr11

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 302


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES1100 Pepper.v.1.5.chr11 486916 5e-27
CaES4530 Pepper.v.1.5.chr11 502477 1e-73
CaES0065 Pepper.v.1.5.chr11 636429 2e-54
CaES3945 Pepper.v.1.5.chr11 709065 3e-79
CaES3360 Pepper.v.1.5.chr11 773507 3e-98
CaES3126 Pepper.v.1.5.chr11 835852 1e-151
CaES4054 Pepper.v.1.5.chr11 856643 1e-98
CaES1833 Pepper.v.1.5.chr11 1055876 3e-99
CaES5128 Pepper.v.1.5.chr11 1114484 1e-74
CaES5426 Pepper.v.1.5.chr11 1158421 1e-114
CaES2814 Pepper.v.1.5.chr11 1172181 8e-54
CaES3227 Pepper.v.1.5.chr11 1172928 1e-105
CaES4244 Pepper.v.1.5.chr11 1271627 1e-48
CaES4929 Pepper.v.1.5.chr11 1496648 1e-101
CaES5423 Pepper.v.1.5.chr11 1541332 9e-78
CaES1766 Pepper.v.1.5.chr11 1584561 1e-127
CaES1116 Pepper.v.1.5.chr11 2263482 1e-136
CaES4114 Pepper.v.1.5.chr11 2307514 1e-153
CaES1173 Pepper.v.1.5.chr11 2382838 1e-145
CaES0535 Pepper.v.1.5.chr11 2615209 7e-43
CaES4324 Pepper.v.1.5.chr11 2652931 1e-107
CaES3655 Pepper.v.1.5.chr11 3019945 9e-50
CaES1462 Pepper.v.1.5.chr11 3077653 3e-55
CaES0486 Pepper.v.1.5.chr11 3315260 6e-27
CaES0762 Pepper.v.1.5.chr11 3530309 1e-118
CaES1524 Pepper.v.1.5.chr11 3570919 1e-54
CaES4141 Pepper.v.1.5.chr11 3639954 1e-107
CaES2438 Pepper.v.1.5.chr11 3717173 1e-108
CaES0636 Pepper.v.1.5.chr11 4043454 1e-82
CaES3875 Pepper.v.1.5.chr11 4596818 1e-125
CaES1316 Pepper.v.1.5.chr11 4732575 1e-137
CaES2616 Pepper.v.1.5.chr11 4967018 1e-136
CaES4915 Pepper.v.1.5.chr11 5094693 1e-115
CaES1944 Pepper.v.1.5.chr11 5104477 2e-61
CaES0412 Pepper.v.1.5.chr11 5569220 1e-139
CaES2191 Pepper.v.1.5.chr11 5729198 1e-125
CaES0009 Pepper.v.1.5.chr11 5803341 5e-62
CaES0855 Pepper.v.1.5.chr11 6129626 1e-110
CaES2202 Pepper.v.1.5.chr11 6953259 1e-128
CaES5496 Pepper.v.1.5.chr11 7100372 9e-74
CaES5283 Pepper.v.1.5.chr11 7145377 1e-112
CaES5549 Pepper.v.1.5.chr11 7364618 8e-29
CaES3237 Pepper.v.1.5.chr11 8437195 1e-105
CaES4958 Pepper.v.1.5.chr11 8914294 4e-27
CaES1373 Pepper.v.1.5.chr11 9714403 6e-93
CaES1491 Pepper.v.1.5.chr11 9831100 1e-53
CaES5041 Pepper.v.1.5.chr11 9986215 1e-120
CaES2582 Pepper.v.1.5.chr11 10148041 3e-72
CaES2598 Pepper.v.1.5.chr11 11288406 1e-128
CaES1607 Pepper.v.1.5.chr11 11793903 1e-144
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 302

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