Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr05

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 295


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1079 Pepper.v.1.5.chr05 6684820 2e-45
CaES4632 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr05 6827117 4e-47
CaES2545 Pepper.v.1.5.chr05 6849656 4e-55
CaES5123 Pepper.v.1.5.chr05 6849656 9e-95
CaES0605 Pepper.v.1.5.chr05 6907853 5e-34
CaES2384 Pepper.v.1.5.chr05 7024323 2e-46
CaES3668 Pepper.v.1.5.chr05 7191145 1e-135
CaES5602 Pepper.v.1.5.chr05 7191196 1e-125
CaES0083 Pepper.v.1.5.chr05 7707792 1e-76
CaES5673 Pepper.v.1.5.chr05 7779702 1e-80
CaES2209 Pepper.v.1.5.chr05 7909795 1e-101
CaES0534 Pepper.v.1.5.chr05 8246324 3e-67
CaES1815 Pepper.v.1.5.chr05 8354296 1e-128
CaES0357 Pepper.v.1.5.chr05 8387203 2e-90
CaES1712 Pepper.v.1.5.chr05 8387203 1e-83
CaES1150 Pepper.v.1.5.chr05 8387203 1e-103
CaES5003 Pepper.v.1.5.chr05 8979183 1e-129
CaES2085 Pepper.v.1.5.chr05 9007495 1e-97
CaES3177 Pepper.v.1.5.chr05 9037660 8e-84
CaES0446 Pepper.v.1.5.chr05 9769952 7e-59
CaES4569 Pepper.v.1.5.chr05 9850593 1e-108
CaES2615 Pepper.v.1.5.chr05 11195254 5e-46
CaES0421 Pepper.v.1.5.chr05 12896884 1e-100
CaES2764 Pepper.v.1.5.chr05 13209561 5e-96
CaES4147 Pepper.v.1.5.chr05 13389249 1e-111
CaES4311 Pepper.v.1.5.chr05 13399047 1e-42
CaES4922 Pepper.v.1.5.chr05 13453926 5e-25
CaES2649 Pepper.v.1.5.chr05 13454192 1e-122
CaES5267 Pepper.v.1.5.chr05 16268770 1e-103
CaES2451 Pepper.v.1.5.chr05 17418015 3e-57
CaES4247 Pepper.v.1.5.chr05 17423209 1e-102
CaES1731 Pepper.v.1.5.chr05 17442170 7e-80
CaES4525 Pepper.v.1.5.chr05 17442919 1e-136
CaES5093 Pepper.v.1.5.chr05 17443649 1e-136
CaES0455 Pepper.v.1.5.chr05 17484290 3e-77
CaES0820 Pepper.v.1.5.chr05 17484433 2e-23
CaES0881 Pepper.v.1.5.chr05 20387842 3e-28
CaES4610 Pepper.v.1.5.chr05 20756865 1e-133
CaES3425 Pepper.v.1.5.chr05 22382038 1e-137
CaES1230 Pepper.v.1.5.chr05 23689330 5e-53
CaES3049 Pepper.v.1.5.chr05 23857327 1e-143
CaES1106 Pepper.v.1.5.chr05 24247441 1e-130
CaES3714 Pepper.v.1.5.chr05 24551498 2e-63
CaES4790 Pepper.v.1.5.chr05 25165181 1e-139
CaES1436 Pepper.v.1.5.chr05 25303544 1e-139
CaES1627 Pepper.v.1.5.chr05 26556034 3e-96
CaES1629 Pepper.v.1.5.chr05 26558002 1e-103
CaES0935 Pepper.v.1.5.chr05 28237099 6e-47
CaES1330 Pepper.v.1.5.chr05 28261873 1e-121
CaES4633 Pepper.v.1.5.chr05 28399239 1e-110
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 295


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