Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2980 Pepper.v.1.5.chr01 164823667 1e-113
CaES4805 Pepper.v.1.5.chr01 164892502 2e-65
CaES4392 Pepper.v.1.5.chr01 165260378 1e-127
CaES2149 Pepper.v.1.5.chr01 165303915 1e-114
CaES3313 Pepper.v.1.5.chr01 165400284 4e-64
CaES0258 Pepper.v.1.5.chr01 165559195 1e-39
CaES1003 0.095 192 Pepper.v.1.5.chr01 165736225 1e-121
CaES0010 Pepper.v.1.5.chr01 165937861 5e-90
CaES5056 Pepper.v.1.5.chr01 167152659 1e-143
CaES5729 Pepper.v.1.5.chr01 167198466 1e-127
CaES5404 Pepper.v.1.5.chr01 168938031 3e-32
CaES1611 Pepper.v.1.5.chr01 169354381 1e-125
CaES3503 Pepper.v.1.5.chr01 170019311 1e-133
CaES1980 Pepper.v.1.5.chr01 170248763 1e-122
CaES3242 Pepper.v.1.5.chr01 172205205 1e-59
CaES2745 Pepper.v.1.5.chr01 172649418 1e-147
CaES4252 Pepper.v.1.5.chr01 173408996 1e-131
CaES5307 Pepper.v.1.5.chr01 173450908 3e-30
CaES0295 Pepper.v.1.5.chr01 173770447 1e-59
CaES0332 Pepper.v.1.5.chr01 173770796 2e-28
CaES4996 Pepper.v.1.5.chr01 173807447 1e-134
CaES4868 Pepper.v.1.5.chr01 174071878 1e-122
CaES4753 Pepper.v.1.5.chr01 174644418 1e-28
CaES3400 Pepper.v.1.5.chr01 174644424 1e-99
CaES3598 Pepper.v.1.5.chr01 175208758 1e-115
CaES3717 Pepper.v.1.5.chr01 175932788 1e-118
CaES0682 Pepper.v.1.5.chr01 175933416 1e-118
CaES5416 Pepper.v.1.5.chr01 175943450 2e-78
CaES2255 Pepper.v.1.5.chr01 177945900 1e-103
CaES2271 Pepper.v.1.5.chr01 179202400 1e-142
CaES5318 Pepper.v.1.5.chr01 180691942 3e-65
CaES3595 Pepper.v.1.5.chr01 180898766 2e-75
CaES3260 Pepper.v.1.5.chr01 182098114 7e-96
CaES1021 Pepper.v.1.5.chr01 182245965 9e-85
CaES1925 Pepper.v.1.5.chr01 182512651 1e-88
CaES1113 Pepper.v.1.5.chr01 182549633 1e-117
CaES0493 Pepper.v.1.5.chr01 182863038 2e-71
CaES4110 Pepper.v.1.5.chr01 183015754 7e-22
CaES5339 Pepper.v.1.5.chr01 185246774 8e-66
CaES2212 Pepper.v.1.5.chr01 188198934 1e-124
CaES2122 Pepper.v.1.5.chr01 188362197 1e-116
CaES1978 Pepper.v.1.5.chr01 188776784 1e-108
CaES5536 Pepper.v.1.5.chr01 188884822 9e-66
CaES1277 Pepper.v.1.5.chr01 188894505 1e-107
CaES3512 Pepper.v.1.5.chr01 190047757 1e-124
CaES5167 Pepper.v.1.5.chr01 190049243 6e-60
CaES2455 Pepper.v.1.5.chr01 190049243 3e-57
CaES1751 Pepper.v.1.5.chr01 190782088 1e-53
CaES3759 Pepper.v.1.5.chr01 192927070 1e-115
CaES1301 Pepper.v.1.5.chr01 193321626 1e-125
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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