Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3364 Pepper.v.1.5.chr01 57643460 5e-26
CaES2749 Pepper.v.1.5.chr01 57692335 1e-143
CaES5160 Pepper.v.1.5.chr01 58786165 1e-22
CaES4623 Pepper.v.1.5.chr01 59134945 1e-75
CaES5677 Pepper.v.1.5.chr01 61071506 1e-145
CaES2943 Pepper.v.1.5.chr01 61274663 1e-126
CaES5591 Pepper.v.1.5.chr01 62427544 1e-41
CaES0823 Pepper.v.1.5.chr01 62427564 2e-91
CaES1407 Pepper.v.1.5.chr01 62482601 5e-63
CaES5088 Pepper.v.1.5.chr01 64297207 2e-99
CaES3241 Pepper.v.1.5.chr01 65742577 3e-62
CaES2148 Pepper.v.1.5.chr01 66910325 1e-55
CaES4475 Pepper.v.1.5.chr01 66913008 1e-131
CaES1319 Pepper.v.1.5.chr01 67274169 1e-138
CaES1683 Pepper.v.1.5.chr01 67276816 4e-33
CaES2878 Pepper.v.1.5.chr01 67424245 1e-100
CaES3607 Pepper.v.1.5.chr01 67767718 6e-22
CaES5571 Pepper.v.1.5.chr01 68298466 3e-24
CaES1061 Pepper.v.1.5.chr01 68304548 1e-137
CaES3163 Pepper.v.1.5.chr01 70531855 1e-142
CaES5278 Pepper.v.1.5.chr01 70955044 1e-104
CaES2714 Pepper.v.1.5.chr01 71851248 1e-137
CaES2780 Pepper.v.1.5.chr01 71865850 1e-106
CaES0408 Pepper.v.1.5.chr01 73337442 1e-88
CaES5551 Pepper.v.1.5.chr01 75041625 6e-77
CaES5719 Pepper.v.1.5.chr01 75042558 1e-115
CaES4528 Pepper.v.1.5.chr01 75538402 1e-106
CaES2620 Pepper.v.1.5.chr01 76107277 2e-23
CaES5459 Pepper.v.1.5.chr01 76691472 9e-46
CaES4072 0.115 191 Pepper.v.1.5.chr01 76794631 1e-115
CaES3330 Pepper.v.1.5.chr01 76828365 1e-61
CaES4960 Pepper.v.1.5.chr01 77253956 1e-167
CaES5190 Pepper.v.1.5.chr01 79209977 1e-124
CaES1952 Pepper.v.1.5.chr01 79705098 3e-90
CaES3572 Pepper.v.1.5.chr01 82579809 8e-95
CaES4540 Pepper.v.1.5.chr01 83891142 1e-103
CaES0633 Pepper.v.1.5.chr01 84160208 1e-113
CaES5016 Pepper.v.1.5.chr01 85573341 5e-90
CaES0921 Pepper.v.1.5.chr01 88072520 3e-55
CaES1141 Pepper.v.1.5.chr01 88436695 4e-88
CaES4383 Pepper.v.1.5.chr01 88439011 1e-135
CaES1831 Pepper.v.1.5.chr01 89759240 4e-76
CaES1696 Pepper.v.1.5.chr01 89783170 1e-120
CaES5317 Pepper.v.1.5.chr01 92450116 6e-57
CaES5070 Pepper.v.1.5.chr01 92940985 3e-32
CaES5645 Pepper.v.1.5.chr01 96897106 2e-96
CaES0886 Pepper.v.1.5.chr01 97901930 5e-86
CaES0646 Pepper.v.1.5.chr01 97902174 1e-151
CaES1084 Pepper.v.1.5.chr01 98325976 5e-95
CaES5292 Pepper.v.1.5.chr01 98327864 1e-130
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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