Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1911 0.0 190 Pepper.v.1.5.chr12 3294607 4e-32
CaES3513 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr12 24760997 1e-100
CaES1465 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr12 78688649 1e-116
CaES2568 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr12 224897294 3e-80
CaES2265 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr12 232457057 1e-120
CaES2306 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr12 232536219 1e-54
CaES3538 0.01 192 Pepper.v.1.5.chr12 81011917 1e-138
CaES5641 Pepper.v.1.5.chr12 11004 1e-103
CaES1577 Pepper.v.1.5.chr12 56419 3e-67
CaES1420 Pepper.v.1.5.chr12 101081 1e-78
CaES5360 Pepper.v.1.5.chr12 125205 6e-68
CaES0274 Pepper.v.1.5.chr12 125581 1e-131
CaES1302 Pepper.v.1.5.chr12 162873 4e-82
CaES4598 Pepper.v.1.5.chr12 166537 9e-53
CaES3379 Pepper.v.1.5.chr12 204325 2e-98
CaES5276 Pepper.v.1.5.chr12 228346 2e-44
CaES5287 Pepper.v.1.5.chr12 778457 1e-66
CaES3700 Pepper.v.1.5.chr12 840884 2e-67
CaES0787 Pepper.v.1.5.chr12 850273 2e-69
CaES3499 Pepper.v.1.5.chr12 1027409 1e-147
CaES4770 Pepper.v.1.5.chr12 1152585 1e-105
CaES1578 Pepper.v.1.5.chr12 1205327 2e-70
CaES2397 Pepper.v.1.5.chr12 1232834 3e-62
CaES2483 Pepper.v.1.5.chr12 1239158 5e-25
CaES1693 Pepper.v.1.5.chr12 1270230 6e-70
CaES1287 Pepper.v.1.5.chr12 1287337 4e-93
CaES0608 Pepper.v.1.5.chr12 1287713 5e-75
CaES4511 Pepper.v.1.5.chr12 1667264 1e-113
CaES3881 Pepper.v.1.5.chr12 1727512 9e-84
CaES2344 Pepper.v.1.5.chr12 1753004 4e-81
CaES0133 Pepper.v.1.5.chr12 1788315 1e-135
CaES0250 Pepper.v.1.5.chr12 1788740 1e-64
CaES5019 Pepper.v.1.5.chr12 1843542 4e-53
CaES5323 Pepper.v.1.5.chr12 2716096 7e-77
CaES4857 Pepper.v.1.5.chr12 2791808 7e-30
CaES1703 Pepper.v.1.5.chr12 3125567 3e-98
CaES3144 Pepper.v.1.5.chr12 3153108 5e-98
CaES0522 Pepper.v.1.5.chr12 3157665 1e-117
CaES5520 Pepper.v.1.5.chr12 3183005 7e-70
CaES0875 Pepper.v.1.5.chr12 3919060 1e-100
CaES4971 Pepper.v.1.5.chr12 4085351 1e-117
CaES1542 Pepper.v.1.5.chr12 4389948 3e-43
CaES0930 Pepper.v.1.5.chr12 4474520 1e-145
CaES2761 Pepper.v.1.5.chr12 4560534 5e-63
CaES5522 Pepper.v.1.5.chr12 5341816 1e-110
CaES1950 Pepper.v.1.5.chr12 5452380 1e-130
CaES2572 Pepper.v.1.5.chr12 5555676 1e-105
CaES0437 Pepper.v.1.5.chr12 5640894 2e-77
CaES2127 Pepper.v.1.5.chr12 5824863 1e-86
CaES5045 Pepper.v.1.5.chr12 5958194 1e-125
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


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