Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1438 Pepper.v.1.5.chr12 207407097 2e-85
CaES2686 Pepper.v.1.5.chr12 207674013 7e-24
CaES3891 Pepper.v.1.5.chr12 207920274 6e-26
CaES4486 Pepper.v.1.5.chr12 208479409 1e-135
CaES5484 Pepper.v.1.5.chr12 210175240 1e-46
CaES3852 Pepper.v.1.5.chr12 212370661 6e-30
CaES1269 Pepper.v.1.5.chr12 212671761 1e-41
CaES3822 Pepper.v.1.5.chr12 212924007 1e-30
CaES3149 Pepper.v.1.5.chr12 213048968 1e-144
CaES0013 Pepper.v.1.5.chr12 213178142 4e-23
CaES5473 Pepper.v.1.5.chr12 213249087 7e-66
CaES3460 Pepper.v.1.5.chr12 213321194 6e-35
CaES3840 Pepper.v.1.5.chr12 213506985 3e-81
CaES1335 Pepper.v.1.5.chr12 213599718 1e-139
CaES1236 Pepper.v.1.5.chr12 213699674 1e-104
CaES2862 Pepper.v.1.5.chr12 213994701 1e-111
CaES0438 Pepper.v.1.5.chr12 214004105 1e-77
CaES0882 Pepper.v.1.5.chr12 214031143 1e-147
CaES2216 Pepper.v.1.5.chr12 214043621 1e-133
CaES1099 Pepper.v.1.5.chr12 214355134 1e-133
CaES3596 Pepper.v.1.5.chr12 214542679 1e-144
CaES0949 Pepper.v.1.5.chr12 214752792 3e-90
CaES3677 Pepper.v.1.5.chr12 214755059 1e-130
CaES1434 Pepper.v.1.5.chr12 214809723 2e-80
CaES0853 Pepper.v.1.5.chr12 215059266 1e-138
CaES3475 Pepper.v.1.5.chr12 215609261 2e-71
CaES2404 Pepper.v.1.5.chr12 215636792 1e-137
CaES2441 Pepper.v.1.5.chr12 216617596 1e-101
CaES2114 Pepper.v.1.5.chr12 217507654 7e-99
CaES4343 Pepper.v.1.5.chr12 217601796 1e-140
CaES0353 Pepper.v.1.5.chr12 217770938 1e-130
CaES0222 Pepper.v.1.5.chr12 217802625 4e-22
CaES4979 Pepper.v.1.5.chr12 219995466 5e-78
CaES3311 Pepper.v.1.5.chr12 220012861 2e-67
CaES5514 Pepper.v.1.5.chr12 220651927 6e-71
CaES2375 Pepper.v.1.5.chr12 221537289 1e-131
CaES0984 Pepper.v.1.5.chr12 221623235 6e-75
CaES1707 Pepper.v.1.5.chr12 221859105 1e-112
CaES5028 Pepper.v.1.5.chr12 221862651 2e-80
CaES0744 Pepper.v.1.5.chr12 221866002 2e-46
CaES0947 Pepper.v.1.5.chr12 222029963 1e-63
CaES0193 Pepper.v.1.5.chr12 222034268 1e-83
CaES2528 Pepper.v.1.5.chr12 222209205 6e-27
CaES1744 Pepper.v.1.5.chr12 222301679 1e-117
CaES3307 Pepper.v.1.5.chr12 222381022 2e-63
CaES2789 Pepper.v.1.5.chr12 222381937 6e-81
CaES2157 Pepper.v.1.5.chr12 222409681 5e-65
CaES0048 Pepper.v.1.5.chr12 222418925 3e-98
CaES3008 Pepper.v.1.5.chr12 222522505 1e-138
CaES1545 Pepper.v.1.5.chr12 223122487 1e-122
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


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