Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2086 Pepper.v.1.5.chr12 83029100 1e-86
CaES0220 Pepper.v.1.5.chr12 86826964 4e-51
CaES4331 Pepper.v.1.5.chr12 87568806 4e-63
CaES3479 Pepper.v.1.5.chr12 87684480 2e-93
CaES4002 Pepper.v.1.5.chr12 87760669 1e-130
CaES4765 Pepper.v.1.5.chr12 90410333 2e-51
CaES0776 Pepper.v.1.5.chr12 91844255 1e-85
CaES5532 Pepper.v.1.5.chr12 95887376 1e-45
CaES1369 Pepper.v.1.5.chr12 97482961 1e-108
CaES5561 Pepper.v.1.5.chr12 102720812 2e-77
CaES4464 Pepper.v.1.5.chr12 104350390 1e-126
CaES3541 Pepper.v.1.5.chr12 104389511 1e-84
CaES4105 Pepper.v.1.5.chr12 105040579 1e-114
CaES0925 Pepper.v.1.5.chr12 116814911 3e-62
CaES0576 Pepper.v.1.5.chr12 120698679 1e-102
CaES3345 Pepper.v.1.5.chr12 123710432 7e-30
CaES1253 Pepper.v.1.5.chr12 124077703 1e-98
CaES3884 Pepper.v.1.5.chr12 124078496 1e-124
CaES1943 Pepper.v.1.5.chr12 124735024 1e-121
CaES3739 Pepper.v.1.5.chr12 124925125 4e-96
CaES5213 Pepper.v.1.5.chr12 125623929 1e-124
CaES5328 Pepper.v.1.5.chr12 126073225 1e-114
CaES4600 Pepper.v.1.5.chr12 126442222 1e-124
CaES5219 Pepper.v.1.5.chr12 126442808 4e-56
CaES4894 Pepper.v.1.5.chr12 127691275 1e-131
CaES0488 Pepper.v.1.5.chr12 129381248 1e-48
CaES5107 Pepper.v.1.5.chr12 131885083 1e-124
CaES3865 Pepper.v.1.5.chr12 132085290 1e-140
CaES2786 Pepper.v.1.5.chr12 132165131 1e-142
CaES1011 Pepper.v.1.5.chr12 134335402 1e-107
CaES1387 Pepper.v.1.5.chr12 134346711 1e-80
CaES0926 Pepper.v.1.5.chr12 134413905 8e-61
CaES4575 Pepper.v.1.5.chr12 135621822 1e-135
CaES4594 Pepper.v.1.5.chr12 142202283 4e-95
CaES2936 Pepper.v.1.5.chr12 146521979 1e-108
CaES1005 Pepper.v.1.5.chr12 152487790 2e-63
CaES4150 Pepper.v.1.5.chr12 152865869 1e-105
CaES1970 Pepper.v.1.5.chr12 154381894 1e-107
CaES1285 Pepper.v.1.5.chr12 155026368 9e-30
CaES2131 Pepper.v.1.5.chr12 155442628 1e-112
CaES0377 Pepper.v.1.5.chr12 155470346 1e-123
CaES1982 Pepper.v.1.5.chr12 157809340 1e-150
CaES0987 Pepper.v.1.5.chr12 160749391 5e-34
CaES4704 Pepper.v.1.5.chr12 162657201 9e-49
CaES2538 Pepper.v.1.5.chr12 165601005 1e-132
CaES3816 Pepper.v.1.5.chr12 166386034 1e-140
CaES0791 Pepper.v.1.5.chr12 169619209 3e-28
CaES3493 Pepper.v.1.5.chr12 172458322 1e-114
CaES0173 Pepper.v.1.5.chr12 174451961 1e-49
CaES0760 Pepper.v.1.5.chr12 175224384 1e-110
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


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