Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr12

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 384


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES2988 Pepper.v.1.5.chr12 32237541 1e-39
CaES3238 Pepper.v.1.5.chr12 32321178 1e-23
CaES3917 Pepper.v.1.5.chr12 32409510 1e-95
CaES4691 Pepper.v.1.5.chr12 32414186 1e-159
CaES3509 Pepper.v.1.5.chr12 32493822 8e-35
CaES1647 Pepper.v.1.5.chr12 32761409 2e-92
CaES3593 Pepper.v.1.5.chr12 32939390 4e-57
CaES0575 Pepper.v.1.5.chr12 33526607 7e-27
CaES1198 Pepper.v.1.5.chr12 34238423 1e-124
CaES2386 Pepper.v.1.5.chr12 34953331 1e-179
CaES1493 Pepper.v.1.5.chr12 35058566 1e-29
CaES3278 Pepper.v.1.5.chr12 35094075 2e-49
CaES3561 Pepper.v.1.5.chr12 35095554 1e-142
CaES4582 Pepper.v.1.5.chr12 35095998 2e-99
CaES3417 Pepper.v.1.5.chr12 35702429 1e-140
CaES3302 Pepper.v.1.5.chr12 36178956 3e-83
CaES2796 Pepper.v.1.5.chr12 36730766 1e-78
CaES0491 Pepper.v.1.5.chr12 36942210 1e-118
CaES2731 Pepper.v.1.5.chr12 37249659 1e-149
CaES2875 Pepper.v.1.5.chr12 38159153 1e-106
CaES2880 Pepper.v.1.5.chr12 38754646 1e-46
CaES4711 Pepper.v.1.5.chr12 39714572 2e-76
CaES4654 Pepper.v.1.5.chr12 39714572 8e-93
CaES3873 Pepper.v.1.5.chr12 41020776 1e-111
CaES2116 Pepper.v.1.5.chr12 44341554 2e-45
CaES3502 Pepper.v.1.5.chr12 44365085 1e-72
CaES4053 Pepper.v.1.5.chr12 46174905 1e-133
CaES2899 Pepper.v.1.5.chr12 46654021 1e-141
CaES2309 Pepper.v.1.5.chr12 46794899 3e-91
CaES2059 Pepper.v.1.5.chr12 51725273 1e-116
CaES1047 Pepper.v.1.5.chr12 53605817 1e-126
CaES1508 Pepper.v.1.5.chr12 54885870 3e-80
CaES2965 Pepper.v.1.5.chr12 58497912 2e-98
CaES3258 Pepper.v.1.5.chr12 58626985 1e-123
CaES0413 Pepper.v.1.5.chr12 63088333 1e-108
CaES4943 Pepper.v.1.5.chr12 63747057 1e-112
CaES3157 Pepper.v.1.5.chr12 64002334 1e-141
CaES2305 Pepper.v.1.5.chr12 64005851 6e-33
CaES1388 Pepper.v.1.5.chr12 64007395 2e-93
CaES5439 Pepper.v.1.5.chr12 67440388 2e-97
CaES5030 Pepper.v.1.5.chr12 67442209 1e-100
CaES0656 Pepper.v.1.5.chr12 74467150 1e-127
CaES0034 Pepper.v.1.5.chr12 76636069 2e-73
CaES0743 Pepper.v.1.5.chr12 77599190 1e-107
CaES1465 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr12 78688649 1e-116
CaES2132 Pepper.v.1.5.chr12 79220076 5e-92
CaES5295 Pepper.v.1.5.chr12 79825215 1e-122
CaES3538 0.01 192 Pepper.v.1.5.chr12 81011917 1e-138
CaES5370 Pepper.v.1.5.chr12 82166642 3e-98
CaES2739 Pepper.v.1.5.chr12 83023240 2e-53
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 384


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