Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr11

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 302


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0009 Pepper.v.1.5.chr11 5803341 5e-62
CaES0014 Pepper.v.1.5.chr11 20833507 2e-81
CaES0020 Pepper.v.1.5.chr11 230853636 1e-103
CaES0029 Pepper.v.1.5.chr11 236382396 8e-56
CaES0043 Pepper.v.1.5.chr11 224886678 1e-102
CaES0056 Pepper.v.1.5.chr11 126743566 7e-86
CaES0061 Pepper.v.1.5.chr11 216715059 4e-91
CaES0062 Pepper.v.1.5.chr11 197762381 1e-119
CaES0063 Pepper.v.1.5.chr11 161583649 3e-62
CaES0065 Pepper.v.1.5.chr11 636429 2e-54
CaES0085 Pepper.v.1.5.chr11 237432755 1e-31
CaES0147 Pepper.v.1.5.chr11 64930501 1e-71
CaES0153 Pepper.v.1.5.chr11 228812481 1e-70
CaES0154 Pepper.v.1.5.chr11 146211999 5e-40
CaES0195 Pepper.v.1.5.chr11 202226079 1e-118
CaES0264 Pepper.v.1.5.chr11 62564532 1e-43
CaES0288 Pepper.v.1.5.chr11 60524926 1e-134
CaES0329 Pepper.v.1.5.chr11 230141135 8e-99
CaES0331 Pepper.v.1.5.chr11 178025656 1e-26
CaES0412 Pepper.v.1.5.chr11 5569220 1e-139
CaES0486 Pepper.v.1.5.chr11 3315260 6e-27
CaES0535 Pepper.v.1.5.chr11 2615209 7e-43
CaES0595 Pepper.v.1.5.chr11 42039104 2e-94
CaES0613 Pepper.v.1.5.chr11 41136175 1e-123
CaES0617 Pepper.v.1.5.chr11 48700832 2e-58
CaES0620 Pepper.v.1.5.chr11 41136175 1e-123
CaES0621 Pepper.v.1.5.chr11 204794156 1e-153
CaES0624 Pepper.v.1.5.chr11 189653078 1e-70
CaES0636 Pepper.v.1.5.chr11 4043454 1e-82
CaES0671 Pepper.v.1.5.chr11 68270463 3e-71
CaES0700 Pepper.v.1.5.chr11 242635870 1e-149
CaES0762 Pepper.v.1.5.chr11 3530309 1e-118
CaES0763 Pepper.v.1.5.chr11 242235090 4e-95
CaES0764 Pepper.v.1.5.chr11 172846447 1e-54
CaES0800 Pepper.v.1.5.chr11 239177135 1e-109
CaES0802 Pepper.v.1.5.chr11 43011409 4e-50
CaES0803 Pepper.v.1.5.chr11 241750998 5e-80
CaES0811 Pepper.v.1.5.chr11 44490486 1e-102
CaES0836 Pepper.v.1.5.chr11 166601622 2e-41
CaES0840 Pepper.v.1.5.chr11 24296326 3e-29
CaES0847 Pepper.v.1.5.chr11 175924718 8e-92
CaES0855 Pepper.v.1.5.chr11 6129626 1e-110
CaES0939 Pepper.v.1.5.chr11 183086943 1e-103
CaES0967 Pepper.v.1.5.chr11 236925193 1e-119
CaES0972 Pepper.v.1.5.chr11 212414612 1e-121
CaES0977 Pepper.v.1.5.chr11 27350982 1e-124
CaES0978 Pepper.v.1.5.chr11 215702221 1e-152
CaES1027 0.016 192 Pepper.v.1.5.chr11 245018649 3e-23
CaES1049 Pepper.v.1.5.chr11 204449928 1e-125
CaES1067 Pepper.v.1.5.chr11 42035106 1e-85
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 302


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