Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr11

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 302


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1598 Pepper.v.1.5.chr11 114372515 6e-83
CaES3310 Pepper.v.1.5.chr11 115976111 6e-55
CaES4423 Pepper.v.1.5.chr11 119627018 1e-60
CaES5364 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr11 120280696 1e-136
CaES1853 Pepper.v.1.5.chr11 123774438 5e-92
CaES4777 Pepper.v.1.5.chr11 123778505 1e-179
CaES0056 Pepper.v.1.5.chr11 126743566 7e-86
CaES3938 Pepper.v.1.5.chr11 128720704 1e-84
CaES5105 Pepper.v.1.5.chr11 136556269 1e-37
CaES2996 Pepper.v.1.5.chr11 137089176 7e-61
CaES5165 Pepper.v.1.5.chr11 141547400 1e-119
CaES2947 Pepper.v.1.5.chr11 142101132 2e-80
CaES3864 Pepper.v.1.5.chr11 142797047 1e-106
CaES3630 Pepper.v.1.5.chr11 142934193 1e-119
CaES0154 Pepper.v.1.5.chr11 146211999 5e-40
CaES4860 Pepper.v.1.5.chr11 146593392 9e-44
CaES3914 Pepper.v.1.5.chr11 150243926 6e-72
CaES3916 Pepper.v.1.5.chr11 155943380 6e-70
CaES4368 Pepper.v.1.5.chr11 156338916 5e-29
CaES2824 Pepper.v.1.5.chr11 157446568 1e-159
CaES1437 Pepper.v.1.5.chr11 157447820 1e-21
CaES5092 0.0 92 Pepper.v.1.5.chr11 158682319 1e-118
CaES2329 Pepper.v.1.5.chr11 159556242 1e-122
CaES0063 Pepper.v.1.5.chr11 161583649 3e-62
CaES2188 Pepper.v.1.5.chr11 161940689 2e-91
CaES4888 Pepper.v.1.5.chr11 162501734 2e-47
CaES2933 Pepper.v.1.5.chr11 162511817 1e-137
CaES1195 Pepper.v.1.5.chr11 163401728 1e-148
CaES3542 Pepper.v.1.5.chr11 166156570 9e-79
CaES0836 Pepper.v.1.5.chr11 166601622 2e-41
CaES1333 Pepper.v.1.5.chr11 168189390 1e-119
CaES3441 Pepper.v.1.5.chr11 168217189 8e-37
CaES3791 Pepper.v.1.5.chr11 169944736 6e-50
CaES3813 Pepper.v.1.5.chr11 170024515 5e-95
CaES4092 Pepper.v.1.5.chr11 171685493 1e-111
CaES2396 Pepper.v.1.5.chr11 171698726 1e-116
CaES0764 Pepper.v.1.5.chr11 172846447 1e-54
CaES5032 Pepper.v.1.5.chr11 174573164 1e-102
CaES4613 0.0 25 Pepper.v.1.5.chr11 175157855 1e-103
CaES4047 Pepper.v.1.5.chr11 175656926 5e-96
CaES2795 Pepper.v.1.5.chr11 175806065 1e-150
CaES3908 Pepper.v.1.5.chr11 175912659 1e-132
CaES0847 Pepper.v.1.5.chr11 175924718 8e-92
CaES2409 Pepper.v.1.5.chr11 175925036 8e-28
CaES1826 Pepper.v.1.5.chr11 177384155 1e-128
CaES0331 Pepper.v.1.5.chr11 178025656 1e-26
CaES2071 Pepper.v.1.5.chr11 179862567 7e-46
CaES2264 Pepper.v.1.5.chr11 181199035 1e-105
CaES3706 Pepper.v.1.5.chr11 181227061 2e-82
CaES0939 Pepper.v.1.5.chr11 183086943 1e-103
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 302


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