Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390

Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
Name Position*
CaES5136 Pepper.v.1.5.chr10 46472873 7e-37
CaES5153 Pepper.v.1.5.chr10 16413095 8e-79
CaES5154 Pepper.v.1.5.chr10 16413095 1e-79
CaES5155 Pepper.v.1.5.chr10 83815940 1e-113
CaES5186 Pepper.v.1.5.chr10 86791287 2e-90
CaES5217 Pepper.v.1.5.chr10 185688876 1e-105
CaES5226 Pepper.v.1.5.chr10 38039327 8e-70
CaES5230 Pepper.v.1.5.chr10 214781112 8e-98
CaES5233 Pepper.v.1.5.chr10 194388486 1e-102
CaES5304 Pepper.v.1.5.chr10 62820819 1e-101
CaES5433 Pepper.v.1.5.chr10 87637383 1e-76
CaES5461 Pepper.v.1.5.chr10 222137771 5e-92
CaES5465 Pepper.v.1.5.chr10 61943717 2e-98
CaES5468 Pepper.v.1.5.chr10 108063346 1e-40
CaES5491 Pepper.v.1.5.chr10 10255825 3e-34
CaES5503 Pepper.v.1.5.chr10 14283518 9e-77
CaES5505 Pepper.v.1.5.chr10 1642320 5e-42
CaES5507 Pepper.v.1.5.chr10 219287898 1e-51
CaES5527 Pepper.v.1.5.chr10 226866421 3e-97
CaES5564 Pepper.v.1.5.chr10 159548189 7e-52
CaES5578 Pepper.v.1.5.chr10 202246228 7e-73
CaES5579 Pepper.v.1.5.chr10 225367573 5e-36
CaES5585 Pepper.v.1.5.chr10 226215162 5e-93
CaES5593 Pepper.v.1.5.chr10 1805594 5e-96
CaES5596 Pepper.v.1.5.chr10 203595155 7e-42
CaES5600 Pepper.v.1.5.chr10 152605349 2e-42
CaES5601 Pepper.v.1.5.chr10 189962020 2e-76
CaES5604 Pepper.v.1.5.chr10 16781968 1e-121
CaES5605 Pepper.v.1.5.chr10 796270 3e-51
CaES5649 Pepper.v.1.5.chr10 207443409 1e-66
CaES5654 Pepper.v.1.5.chr10 4090085 1e-63
CaES5660 Pepper.v.1.5.chr10 216840037 2e-81
CaES5671 Pepper.v.1.5.chr10 38354397 1e-104
CaES5692 Pepper.v.1.5.chr10 56280599 1e-118
CaES5700 Pepper.v.1.5.chr10 202122230 1e-102
CaES5727 Pepper.v.1.5.chr10 181575692 1e-119
CaES5733 Pepper.v.1.5.chr10 7979234 3e-78
CaES5740 Pepper.v.1.5.chr10 188577162 2e-99
CaES5742 Pepper.v.1.5.chr10 9009146 2e-25
CaES5748 Pepper.v.1.5.chr10 93995710 6e-95
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390

MarkerDB | Capsicum annuum