Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr10

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 390


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3181 Pepper.v.1.5.chr10 6633745 5e-58
CaES3184 Pepper.v.1.5.chr10 6633745 2e-58
CaES4954 Pepper.v.1.5.chr10 6803540 1e-134
CaES0444 Pepper.v.1.5.chr10 7780312 4e-66
CaES0799 Pepper.v.1.5.chr10 7928317 1e-156
CaES5733 Pepper.v.1.5.chr10 7979234 3e-78
CaES2117 Pepper.v.1.5.chr10 7980304 1e-109
CaES2221 Pepper.v.1.5.chr10 8012529 4e-27
CaES1088 Pepper.v.1.5.chr10 8068479 3e-86
CaES3634 Pepper.v.1.5.chr10 8836192 4e-93
CaES4077 Pepper.v.1.5.chr10 8864860 3e-76
CaES5742 Pepper.v.1.5.chr10 9009146 2e-25
CaES2357 Pepper.v.1.5.chr10 9041198 1e-125
CaES0872 Pepper.v.1.5.chr10 10230367 1e-131
CaES5491 Pepper.v.1.5.chr10 10255825 3e-34
CaES0115 Pepper.v.1.5.chr10 10305579 1e-89
CaES3996 Pepper.v.1.5.chr10 10349931 1e-121
CaES0611 Pepper.v.1.5.chr10 10411279 7e-64
CaES2076 Pepper.v.1.5.chr10 10419093 2e-72
CaES3013 Pepper.v.1.5.chr10 10580523 1e-134
CaES1679 Pepper.v.1.5.chr10 11013498 1e-141
CaES3285 Pepper.v.1.5.chr10 11169658 1e-109
CaES4692 Pepper.v.1.5.chr10 11227130 2e-52
CaES5503 Pepper.v.1.5.chr10 14283518 9e-77
CaES4250 Pepper.v.1.5.chr10 14889376 1e-104
CaES1716 Pepper.v.1.5.chr10 15810616 1e-122
CaES3191 Pepper.v.1.5.chr10 16413095 2e-81
CaES3196 Pepper.v.1.5.chr10 16413095 1e-88
CaES5153 Pepper.v.1.5.chr10 16413095 8e-79
CaES5154 Pepper.v.1.5.chr10 16413095 1e-79
CaES3190 Pepper.v.1.5.chr10 16413206 6e-83
CaES3187 Pepper.v.1.5.chr10 16413339 3e-57
CaES3199 Pepper.v.1.5.chr10 16413413 4e-62
CaES5604 Pepper.v.1.5.chr10 16781968 1e-121
CaES0475 Pepper.v.1.5.chr10 17746319 1e-123
CaES3932 Pepper.v.1.5.chr10 18265824 1e-109
CaES2072 Pepper.v.1.5.chr10 18901461 4e-96
CaES3038 Pepper.v.1.5.chr10 19601943 2e-66
CaES2847 Pepper.v.1.5.chr10 19676169 6e-75
CaES3611 Pepper.v.1.5.chr10 19860485 1e-122
CaES5125 Pepper.v.1.5.chr10 22376352 1e-40
CaES4088 Pepper.v.1.5.chr10 27153782 5e-78
CaES3147 Pepper.v.1.5.chr10 29384399 3e-97
CaES3131 Pepper.v.1.5.chr10 29449762 1e-118
CaES0609 Pepper.v.1.5.chr10 31279949 1e-122
CaES3523 Pepper.v.1.5.chr10 31905889 1e-125
CaES4483 Pepper.v.1.5.chr10 33895496 1e-108
CaES3918 Pepper.v.1.5.chr10 35512870 1e-112
CaES0506 Pepper.v.1.5.chr10 35530974 3e-94
CaES1734 Pepper.v.1.5.chr10 36030308 4e-21
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 390


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