Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr08

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 273


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1324 0.0 190 Pepper.v.1.5.chr08 14761176 1e-108
CaES3612 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr08 46954912 1e-162
CaES4042 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr08 63818171 1e-126
CaES1051 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr08 117252190 1e-143
CaES3862 0.17 192 Pepper.v.1.5.chr08 1838016 1e-143
CaES1711 0.474 140 Pepper.v.1.5.chr08 131373766 2e-77
CaES4410 0.498 191 Pepper.v.1.5.chr08 78590091 1e-111
CaES5639 Pepper.v.1.5.chr08 567044 1e-102
CaES2599 Pepper.v.1.5.chr08 689303 1e-130
CaES2274 Pepper.v.1.5.chr08 764126 1e-111
CaES4397 Pepper.v.1.5.chr08 765791 9e-89
CaES1575 Pepper.v.1.5.chr08 855376 4e-46
CaES3170 Pepper.v.1.5.chr08 938058 2e-78
CaES3579 Pepper.v.1.5.chr08 939041 1e-140
CaES3761 Pepper.v.1.5.chr08 939275 8e-85
CaES3757 Pepper.v.1.5.chr08 980927 1e-103
CaES4693 Pepper.v.1.5.chr08 997253 1e-50
CaES5009 Pepper.v.1.5.chr08 1031234 1e-122
CaES5606 Pepper.v.1.5.chr08 1105573 2e-38
CaES4117 Pepper.v.1.5.chr08 1126585 5e-63
CaES1559 Pepper.v.1.5.chr08 1177746 1e-51
CaES4564 Pepper.v.1.5.chr08 1177764 1e-118
CaES1992 Pepper.v.1.5.chr08 1191733 1e-117
CaES4937 Pepper.v.1.5.chr08 1211727 1e-127
CaES3689 Pepper.v.1.5.chr08 1247988 1e-136
CaES1394 Pepper.v.1.5.chr08 1279628 1e-151
CaES0054 Pepper.v.1.5.chr08 1727535 1e-117
CaES0398 Pepper.v.1.5.chr08 1960118 1e-89
CaES4719 Pepper.v.1.5.chr08 2206497 8e-82
CaES3161 Pepper.v.1.5.chr08 2383490 6e-97
CaES3372 Pepper.v.1.5.chr08 2428260 1e-136
CaES3168 Pepper.v.1.5.chr08 2692131 1e-58
CaES2891 Pepper.v.1.5.chr08 2719592 4e-36
CaES2783 Pepper.v.1.5.chr08 2764407 1e-72
CaES1490 Pepper.v.1.5.chr08 2926717 5e-46
CaES4629 Pepper.v.1.5.chr08 2931788 3e-74
CaES0950 Pepper.v.1.5.chr08 2932168 2e-85
CaES0239 Pepper.v.1.5.chr08 2939183 2e-25
CaES1354 Pepper.v.1.5.chr08 2942766 1e-113
CaES2066 Pepper.v.1.5.chr08 2991416 4e-91
CaES4816 Pepper.v.1.5.chr08 3606073 3e-63
CaES2183 Pepper.v.1.5.chr08 6240045 1e-119
CaES1558 Pepper.v.1.5.chr08 7474192 5e-53
CaES4169 Pepper.v.1.5.chr08 9863138 1e-107
CaES2937 Pepper.v.1.5.chr08 14800219 1e-103
CaES4432 Pepper.v.1.5.chr08 15541150 1e-146
CaES1646 Pepper.v.1.5.chr08 17119695 1e-70
CaES3327 Pepper.v.1.5.chr08 24842937 1e-110
CaES0687 Pepper.v.1.5.chr08 24843438 2e-95
CaES0128 Pepper.v.1.5.chr08 29850862 1e-105
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 273


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