Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr07

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 409


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0016 Pepper.v.1.5.chr07 12640247 1e-111
CaES0017 Pepper.v.1.5.chr07 174396458 4e-29
CaES0040 Pepper.v.1.5.chr07 225988084 1e-107
CaES0049 Pepper.v.1.5.chr07 201075828 1e-99
CaES0058 Pepper.v.1.5.chr07 220032106 2e-80
CaES0087 Pepper.v.1.5.chr07 10005795 1e-120
CaES0126 Pepper.v.1.5.chr07 430146 2e-64
CaES0139 Pepper.v.1.5.chr07 9810199 2e-54
CaES0150 Pepper.v.1.5.chr07 217166050 1e-25
CaES0165 Pepper.v.1.5.chr07 119770732 8e-58
CaES0182 Pepper.v.1.5.chr07 145069042 1e-116
CaES0186 Pepper.v.1.5.chr07 225574093 5e-56
CaES0206 Pepper.v.1.5.chr07 217175382 1e-100
CaES0228 Pepper.v.1.5.chr07 145068550 1e-112
CaES0235 Pepper.v.1.5.chr07 3893078 4e-44
CaES0245 Pepper.v.1.5.chr07 13716060 1e-103
CaES0257 Pepper.v.1.5.chr07 192796682 1e-55
CaES0265 Pepper.v.1.5.chr07 215803271 1e-37
CaES0271 Pepper.v.1.5.chr07 166183 3e-75
CaES0286 Pepper.v.1.5.chr07 225575701 8e-76
CaES0305 Pepper.v.1.5.chr07 20171917 1e-113
CaES0322 Pepper.v.1.5.chr07 34904375 6e-99
CaES0324 Pepper.v.1.5.chr07 180812689 1e-67
CaES0346 Pepper.v.1.5.chr07 209940582 1e-132
CaES0352 Pepper.v.1.5.chr07 217837490 1e-139
CaES0366 Pepper.v.1.5.chr07 215461196 1e-103
CaES0391 Pepper.v.1.5.chr07 205831119 1e-113
CaES0393 Pepper.v.1.5.chr07 220779344 6e-92
CaES0399 Pepper.v.1.5.chr07 9625442 1e-116
CaES0407 Pepper.v.1.5.chr07 57891884 1e-127
CaES0423 Pepper.v.1.5.chr07 215926337 1e-136
CaES0424 Pepper.v.1.5.chr07 184185119 4e-86
CaES0501 Pepper.v.1.5.chr07 64038636 5e-41
CaES0503 Pepper.v.1.5.chr07 101582943 3e-74
CaES0507 Pepper.v.1.5.chr07 3867457 3e-73
CaES0515 Pepper.v.1.5.chr07 203905263 6e-73
CaES0531 Pepper.v.1.5.chr07 95125742 1e-114
CaES0538 Pepper.v.1.5.chr07 106388 1e-81
CaES0546 Pepper.v.1.5.chr07 221120169 1e-100
CaES0550 Pepper.v.1.5.chr07 740244 1e-141
CaES0557 Pepper.v.1.5.chr07 16236785 1e-113
CaES0567 Pepper.v.1.5.chr07 49622246 1e-100
CaES0590 Pepper.v.1.5.chr07 31627949 1e-25
CaES0594 Pepper.v.1.5.chr07 698242 7e-61
CaES0597 Pepper.v.1.5.chr07 2612020 1e-125
CaES0600 Pepper.v.1.5.chr07 21969826 1e-111
CaES0625 Pepper.v.1.5.chr07 197933322 1e-139
CaES0628 Pepper.v.1.5.chr07 200572791 1e-123
CaES0644 Pepper.v.1.5.chr07 11518556 3e-94
CaES0674 Pepper.v.1.5.chr07 178152729 2e-94
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 409


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