Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr05

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 295


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4632 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr05 6827117 4e-47
CaES2854 0.0 190 Pepper.v.1.5.chr05 87125479 1e-156
CaES2332 0.476 192 Pepper.v.1.5.chr05 301256 1e-145
CaES3447 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr05 56401956 1e-149
CaES2010 Pepper.v.1.5.chr05 76314 1e-151
CaES0574 Pepper.v.1.5.chr05 83864 8e-42
CaES0738 Pepper.v.1.5.chr05 252932 1e-108
CaES2779 Pepper.v.1.5.chr05 299571 1e-129
CaES2135 Pepper.v.1.5.chr05 372473 1e-141
CaES1741 Pepper.v.1.5.chr05 378706 9e-66
CaES2360 Pepper.v.1.5.chr05 527511 2e-75
CaES0205 Pepper.v.1.5.chr05 541119 1e-80
CaES4844 Pepper.v.1.5.chr05 551940 1e-79
CaES1709 Pepper.v.1.5.chr05 766544 4e-70
CaES3154 Pepper.v.1.5.chr05 818396 1e-142
CaES4241 Pepper.v.1.5.chr05 832255 7e-90
CaES2565 Pepper.v.1.5.chr05 976567 2e-74
CaES5098 Pepper.v.1.5.chr05 987707 9e-46
CaES4901 Pepper.v.1.5.chr05 993048 1e-116
CaES5308 Pepper.v.1.5.chr05 1017312 7e-96
CaES5005 Pepper.v.1.5.chr05 1021042 1e-138
CaES0697 Pepper.v.1.5.chr05 1067854 7e-83
CaES0327 Pepper.v.1.5.chr05 1093572 4e-33
CaES5237 Pepper.v.1.5.chr05 1093750 2e-47
CaES0080 Pepper.v.1.5.chr05 1595904 1e-141
CaES3067 Pepper.v.1.5.chr05 1668371 1e-109
CaES0914 Pepper.v.1.5.chr05 1681561 1e-120
CaES1896 Pepper.v.1.5.chr05 1685038 1e-130
CaES2043 Pepper.v.1.5.chr05 1849968 1e-75
CaES5559 Pepper.v.1.5.chr05 1867487 8e-46
CaES0129 Pepper.v.1.5.chr05 1911842 5e-54
CaES0641 Pepper.v.1.5.chr05 1963459 1e-124
CaES3525 Pepper.v.1.5.chr05 2029094 1e-107
CaES5365 Pepper.v.1.5.chr05 2050177 1e-102
CaES1358 Pepper.v.1.5.chr05 2290037 1e-145
CaES1286 Pepper.v.1.5.chr05 2333414 1e-126
CaES2860 Pepper.v.1.5.chr05 2717686 7e-72
CaES1923 Pepper.v.1.5.chr05 3310735 1e-146
CaES0465 Pepper.v.1.5.chr05 3379488 1e-104
CaES0148 Pepper.v.1.5.chr05 3489544 1e-135
CaES1676 Pepper.v.1.5.chr05 4766101 1e-100
CaES3197 Pepper.v.1.5.chr05 5401032 1e-116
CaES0890 Pepper.v.1.5.chr05 5503636 3e-44
CaES0817 Pepper.v.1.5.chr05 5508332 9e-71
CaES2012 Pepper.v.1.5.chr05 5519532 1e-153
CaES2709 Pepper.v.1.5.chr05 5582355 1e-121
CaES3288 Pepper.v.1.5.chr05 5582538 1e-131
CaES0637 Pepper.v.1.5.chr05 5815372 1e-53
CaES4262 Pepper.v.1.5.chr05 5854202 1e-128
CaES0562 Pepper.v.1.5.chr05 6091876 1e-64
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 295


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