Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr05

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 295


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0055 Pepper.v.1.5.chr05 210340645 1e-105
CaES0069 Pepper.v.1.5.chr05 68299850 4e-69
CaES0080 Pepper.v.1.5.chr05 1595904 1e-141
CaES0083 Pepper.v.1.5.chr05 7707792 1e-76
CaES0129 Pepper.v.1.5.chr05 1911842 5e-54
CaES0141 Pepper.v.1.5.chr05 214794300 1e-29
CaES0145 Pepper.v.1.5.chr05 210105997 1e-53
CaES0148 Pepper.v.1.5.chr05 3489544 1e-135
CaES0174 Pepper.v.1.5.chr05 214430134 9e-42
CaES0183 Pepper.v.1.5.chr05 193070889 1e-73
CaES0205 Pepper.v.1.5.chr05 541119 1e-80
CaES0214 Pepper.v.1.5.chr05 32663419 1e-30
CaES0231 Pepper.v.1.5.chr05 6296373 1e-152
CaES0234 Pepper.v.1.5.chr05 173171577 1e-116
CaES0269 Pepper.v.1.5.chr05 186920648 1e-109
CaES0301 Pepper.v.1.5.chr05 188214710 1e-143
CaES0327 Pepper.v.1.5.chr05 1093572 4e-33
CaES0328 Pepper.v.1.5.chr05 215975863 2e-89
CaES0357 Pepper.v.1.5.chr05 8387203 2e-90
CaES0365 Pepper.v.1.5.chr05 221167215 4e-63
CaES0414 Pepper.v.1.5.chr05 68726504 1e-23
CaES0421 Pepper.v.1.5.chr05 12896884 1e-100
CaES0446 Pepper.v.1.5.chr05 9769952 7e-59
CaES0455 Pepper.v.1.5.chr05 17484290 3e-77
CaES0465 Pepper.v.1.5.chr05 3379488 1e-104
CaES0524 Pepper.v.1.5.chr05 184912167 1e-117
CaES0529 Pepper.v.1.5.chr05 61622601 6e-24
CaES0534 Pepper.v.1.5.chr05 8246324 3e-67
CaES0551 Pepper.v.1.5.chr05 40696710 4e-70
CaES0562 Pepper.v.1.5.chr05 6091876 1e-64
CaES0571 Pepper.v.1.5.chr05 216400520 1e-117
CaES0574 Pepper.v.1.5.chr05 83864 8e-42
CaES0591 Pepper.v.1.5.chr05 219194647 1e-112
CaES0605 Pepper.v.1.5.chr05 6907853 5e-34
CaES0626 Pepper.v.1.5.chr05 33731344 1e-117
CaES0637 Pepper.v.1.5.chr05 5815372 1e-53
CaES0641 Pepper.v.1.5.chr05 1963459 1e-124
CaES0643 Pepper.v.1.5.chr05 214239189 1e-108
CaES0645 Pepper.v.1.5.chr05 221839321 1e-136
CaES0697 Pepper.v.1.5.chr05 1067854 7e-83
CaES0738 Pepper.v.1.5.chr05 252932 1e-108
CaES0770 Pepper.v.1.5.chr05 214240620 8e-49
CaES0775 Pepper.v.1.5.chr05 192875853 1e-146
CaES0817 Pepper.v.1.5.chr05 5508332 9e-71
CaES0820 Pepper.v.1.5.chr05 17484433 2e-23
CaES0845 Pepper.v.1.5.chr05 45425165 3e-21
CaES0866 Pepper.v.1.5.chr05 180469425 1e-25
CaES0881 Pepper.v.1.5.chr05 20387842 3e-28
CaES0890 Pepper.v.1.5.chr05 5503636 3e-44
CaES0900 Pepper.v.1.5.chr05 157613976 3e-84
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 295


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