Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr05

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 295


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3494 Pepper.v.1.5.chr05 93022248 3e-38
CaES3893 Pepper.v.1.5.chr05 94612518 1e-134
CaES3125 Pepper.v.1.5.chr05 100805589 1e-122
CaES2462 Pepper.v.1.5.chr05 100865844 4e-73
CaES4548 Pepper.v.1.5.chr05 101448776 1e-87
CaES2668 Pepper.v.1.5.chr05 101449521 6e-38
CaES2909 Pepper.v.1.5.chr05 104941740 1e-113
CaES3055 Pepper.v.1.5.chr05 108981166 2e-96
CaES1379 Pepper.v.1.5.chr05 110201537 1e-84
CaES3188 Pepper.v.1.5.chr05 115500359 1e-136
CaES1498 Pepper.v.1.5.chr05 120176710 4e-37
CaES5051 Pepper.v.1.5.chr05 125832253 9e-41
CaES1402 Pepper.v.1.5.chr05 126157308 1e-131
CaES2307 Pepper.v.1.5.chr05 126753630 1e-143
CaES4429 Pepper.v.1.5.chr05 126753754 1e-103
CaES2258 Pepper.v.1.5.chr05 126758274 9e-96
CaES2218 Pepper.v.1.5.chr05 127748360 2e-70
CaES0905 Pepper.v.1.5.chr05 128239986 1e-138
CaES2459 Pepper.v.1.5.chr05 132953562 1e-101
CaES3481 Pepper.v.1.5.chr05 132984052 1e-125
CaES1546 Pepper.v.1.5.chr05 133818379 1e-47
CaES2851 Pepper.v.1.5.chr05 134778277 1e-132
CaES4044 Pepper.v.1.5.chr05 135015581 1e-118
CaES4118 Pepper.v.1.5.chr05 135624582 1e-90
CaES4909 Pepper.v.1.5.chr05 135630521 1e-130
CaES5004 Pepper.v.1.5.chr05 136203964 3e-33
CaES3470 Pepper.v.1.5.chr05 136886647 1e-120
CaES1374 Pepper.v.1.5.chr05 137053941 1e-144
CaES2685 Pepper.v.1.5.chr05 137340950 9e-89
CaES5648 Pepper.v.1.5.chr05 139139775 7e-32
CaES4300 Pepper.v.1.5.chr05 139310310 1e-109
CaES4481 Pepper.v.1.5.chr05 141478070 5e-85
CaES2408 Pepper.v.1.5.chr05 142398715 4e-21
CaES3390 Pepper.v.1.5.chr05 142919330 7e-83
CaES2929 Pepper.v.1.5.chr05 148925246 1e-129
CaES1074 Pepper.v.1.5.chr05 157284078 1e-135
CaES0900 Pepper.v.1.5.chr05 157613976 3e-84
CaES5681 Pepper.v.1.5.chr05 157615406 1e-131
CaES4705 Pepper.v.1.5.chr05 158615628 1e-124
CaES4450 Pepper.v.1.5.chr05 159858542 1e-134
CaES2002 Pepper.v.1.5.chr05 162338404 2e-93
CaES1857 Pepper.v.1.5.chr05 164789732 1e-106
CaES5338 Pepper.v.1.5.chr05 165518552 4e-76
CaES3374 Pepper.v.1.5.chr05 166105543 1e-110
CaES3751 Pepper.v.1.5.chr05 169801279 2e-37
CaES1454 Pepper.v.1.5.chr05 169807490 8e-95
CaES4013 Pepper.v.1.5.chr05 171433563 7e-81
CaES0994 Pepper.v.1.5.chr05 172482552 1e-107
CaES4853 Pepper.v.1.5.chr05 173155437 1e-86
CaES0234 Pepper.v.1.5.chr05 173171577 1e-116
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 295


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