Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr05

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 295


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3694 Pepper.v.1.5.chr05 29471067 1e-136
CaES0960 Pepper.v.1.5.chr05 29471628 8e-27
CaES3020 Pepper.v.1.5.chr05 29472806 1e-130
CaES1020 Pepper.v.1.5.chr05 29911072 7e-57
CaES5613 Pepper.v.1.5.chr05 31705696 1e-135
CaES1060 Pepper.v.1.5.chr05 32155015 4e-39
CaES0214 Pepper.v.1.5.chr05 32663419 1e-30
CaES0626 Pepper.v.1.5.chr05 33731344 1e-117
CaES4752 Pepper.v.1.5.chr05 34920809 8e-36
CaES1733 Pepper.v.1.5.chr05 37482094 5e-59
CaES2966 Pepper.v.1.5.chr05 40377354 3e-88
CaES1399 Pepper.v.1.5.chr05 40696572 1e-86
CaES0551 Pepper.v.1.5.chr05 40696710 4e-70
CaES2994 Pepper.v.1.5.chr05 41610215 1e-149
CaES5394 Pepper.v.1.5.chr05 42933575 2e-40
CaES2654 Pepper.v.1.5.chr05 45242950 3e-61
CaES4495 Pepper.v.1.5.chr05 45244071 1e-111
CaES0845 Pepper.v.1.5.chr05 45425165 3e-21
CaES3841 Pepper.v.1.5.chr05 45425859 2e-49
CaES3383 Pepper.v.1.5.chr05 48578252 2e-90
CaES1839 Pepper.v.1.5.chr05 48809489 1e-110
CaES1305 Pepper.v.1.5.chr05 48916921 1e-39
CaES4465 Pepper.v.1.5.chr05 48916921 1e-39
CaES5067 Pepper.v.1.5.chr05 48928361 1e-112
CaES1756 Pepper.v.1.5.chr05 51565624 1e-109
CaES5145 Pepper.v.1.5.chr05 51946954 1e-133
CaES3506 Pepper.v.1.5.chr05 52897600 1e-136
CaES3233 Pepper.v.1.5.chr05 54392705 1e-142
CaES3447 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr05 56401956 1e-149
CaES3080 Pepper.v.1.5.chr05 56418633 1e-126
CaES2939 Pepper.v.1.5.chr05 56753958 1e-110
CaES3574 Pepper.v.1.5.chr05 61622601 9e-24
CaES0529 Pepper.v.1.5.chr05 61622601 6e-24
CaES5284 Pepper.v.1.5.chr05 63889941 1e-125
CaES1849 Pepper.v.1.5.chr05 64064749 5e-36
CaES2004 Pepper.v.1.5.chr05 64065285 2e-21
CaES1308 Pepper.v.1.5.chr05 66826218 1e-131
CaES3159 Pepper.v.1.5.chr05 67820253 8e-43
CaES0069 Pepper.v.1.5.chr05 68299850 4e-69
CaES0414 Pepper.v.1.5.chr05 68726504 1e-23
CaES2562 Pepper.v.1.5.chr05 71109046 4e-85
CaES1009 Pepper.v.1.5.chr05 72670250 2e-46
CaES2944 Pepper.v.1.5.chr05 73241955 1e-123
CaES4161 Pepper.v.1.5.chr05 77833529 1e-119
CaES3990 Pepper.v.1.5.chr05 78217389 1e-122
CaES1708 Pepper.v.1.5.chr05 78662807 1e-118
CaES5669 Pepper.v.1.5.chr05 78664293 3e-89
CaES2363 Pepper.v.1.5.chr05 84946000 2e-40
CaES2854 0.0 190 Pepper.v.1.5.chr05 87125479 1e-156
CaES3007 Pepper.v.1.5.chr05 88541453 1e-107
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 295


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