Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr04

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 307


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES2210 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr04 13953656 9e-52
CaES3680 0.0 191 Pepper.v.1.5.chr04 176290308 4e-95
CaES5183 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr04 33755400 1e-152
CaES2513 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr04 150718834 3e-41
CaES3524 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr04 205666777 1e-23
CaES2992 Pepper.v.1.5.chr04 311569 1e-117
CaES0105 Pepper.v.1.5.chr04 476356 1e-136
CaES5658 Pepper.v.1.5.chr04 728323 1e-119
CaES2302 Pepper.v.1.5.chr04 5594280 1e-116
CaES2015 Pepper.v.1.5.chr04 5603191 1e-97
CaES4735 Pepper.v.1.5.chr04 5780176 1e-108
CaES5736 Pepper.v.1.5.chr04 5780310 1e-100
CaES2512 Pepper.v.1.5.chr04 5930011 4e-79
CaES3451 Pepper.v.1.5.chr04 5941767 1e-138
CaES1613 Pepper.v.1.5.chr04 6133173 7e-71
CaES3133 Pepper.v.1.5.chr04 6197765 1e-116
CaES2515 Pepper.v.1.5.chr04 6257681 4e-72
CaES5140 Pepper.v.1.5.chr04 6257899 1e-126
CaES2918 Pepper.v.1.5.chr04 6376635 2e-94
CaES4607 Pepper.v.1.5.chr04 6376644 9e-75
CaES2726 Pepper.v.1.5.chr04 6815214 1e-117
CaES1271 Pepper.v.1.5.chr04 6980604 1e-30
CaES3399 Pepper.v.1.5.chr04 7303654 5e-38
CaES2507 Pepper.v.1.5.chr04 8352461 4e-63
CaES1091 Pepper.v.1.5.chr04 8582658 1e-117
CaES5026 Pepper.v.1.5.chr04 8608712 1e-143
CaES1052 Pepper.v.1.5.chr04 8772867 1e-70
CaES0359 Pepper.v.1.5.chr04 8779776 1e-104
CaES3716 Pepper.v.1.5.chr04 8807650 4e-53
CaES0071 Pepper.v.1.5.chr04 9019843 1e-112
CaES5698 Pepper.v.1.5.chr04 9030066 1e-104
CaES3337 Pepper.v.1.5.chr04 9372997 2e-82
CaES0693 Pepper.v.1.5.chr04 9379498 1e-118
CaES2130 Pepper.v.1.5.chr04 9404051 1e-109
CaES3550 Pepper.v.1.5.chr04 10189652 1e-111
CaES4741 Pepper.v.1.5.chr04 11495109 4e-77
CaES0152 Pepper.v.1.5.chr04 12213030 2e-39
CaES5452 Pepper.v.1.5.chr04 12623071 6e-40
CaES4165 Pepper.v.1.5.chr04 12716884 1e-152
CaES2716 Pepper.v.1.5.chr04 12735248 1e-137
CaES2514 Pepper.v.1.5.chr04 12743693 1e-123
CaES1272 Pepper.v.1.5.chr04 12854182 2e-63
CaES4709 Pepper.v.1.5.chr04 13228092 3e-39
CaES1433 Pepper.v.1.5.chr04 13411640 1e-123
CaES2755 Pepper.v.1.5.chr04 13704146 2e-57
CaES2060 Pepper.v.1.5.chr04 13959304 3e-48
CaES4989 Pepper.v.1.5.chr04 14130488 1e-125
CaES3781 Pepper.v.1.5.chr04 14686088 2e-40
CaES2701 Pepper.v.1.5.chr04 14733597 3e-56
CaES4176 Pepper.v.1.5.chr04 14747025 7e-68
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 307

MarkerDB | Capsicum annuum