Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr04

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 307


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0390 Pepper.v.1.5.chr04 201495017 6e-95
CaES2782 Pepper.v.1.5.chr04 201516929 1e-153
CaES5130 Pepper.v.1.5.chr04 201535194 1e-155
CaES3582 Pepper.v.1.5.chr04 201536029 6e-62
CaES2319 Pepper.v.1.5.chr04 201911405 1e-109
CaES2036 Pepper.v.1.5.chr04 201914034 1e-107
CaES0447 Pepper.v.1.5.chr04 201957121 1e-109
CaES0519 Pepper.v.1.5.chr04 201965404 1e-109
CaES0341 Pepper.v.1.5.chr04 202094110 1e-114
CaES2224 Pepper.v.1.5.chr04 202285746 1e-125
CaES2705 Pepper.v.1.5.chr04 202382070 1e-147
CaES5112 Pepper.v.1.5.chr04 202522709 9e-91
CaES5126 Pepper.v.1.5.chr04 202522709 1e-113
CaES1694 Pepper.v.1.5.chr04 202543057 1e-121
CaES1505 Pepper.v.1.5.chr04 202638552 1e-80
CaES2656 Pepper.v.1.5.chr04 202671535 1e-141
CaES1948 Pepper.v.1.5.chr04 202712337 6e-88
CaES3216 Pepper.v.1.5.chr04 202734089 3e-34
CaES3626 Pepper.v.1.5.chr04 203288593 3e-98
CaES1953 Pepper.v.1.5.chr04 203612036 3e-97
CaES4080 Pepper.v.1.5.chr04 203676486 1e-137
CaES3644 Pepper.v.1.5.chr04 203689176 1e-147
CaES1825 Pepper.v.1.5.chr04 203736146 5e-64
CaES1367 Pepper.v.1.5.chr04 203743942 7e-87
CaES3114 Pepper.v.1.5.chr04 204266796 4e-36
CaES3921 Pepper.v.1.5.chr04 204493044 2e-83
CaES4018 Pepper.v.1.5.chr04 204662815 1e-129
CaES3455 Pepper.v.1.5.chr04 204693017 1e-126
CaES4992 Pepper.v.1.5.chr04 204763087 4e-62
CaES3742 Pepper.v.1.5.chr04 204812114 1e-106
CaES1310 Pepper.v.1.5.chr04 204837173 1e-124
CaES5545 Pepper.v.1.5.chr04 204928733 3e-80
CaES2881 Pepper.v.1.5.chr04 204951238 2e-32
CaES1645 Pepper.v.1.5.chr04 204958872 9e-89
CaES4921 Pepper.v.1.5.chr04 205007724 2e-57
CaES2247 Pepper.v.1.5.chr04 205007886 1e-127
CaES2826 Pepper.v.1.5.chr04 205026459 5e-64
CaES0834 Pepper.v.1.5.chr04 205063853 6e-88
CaES2167 Pepper.v.1.5.chr04 205064140 1e-124
CaES4258 Pepper.v.1.5.chr04 205141996 1e-126
CaES4863 Pepper.v.1.5.chr04 205142192 1e-131
CaES5475 Pepper.v.1.5.chr04 205148244 4e-54
CaES2399 Pepper.v.1.5.chr04 205323605 6e-72
CaES3430 Pepper.v.1.5.chr04 205368820 1e-135
CaES1905 Pepper.v.1.5.chr04 205369040 3e-56
CaES3437 Pepper.v.1.5.chr04 205563491 1e-144
CaES5708 Pepper.v.1.5.chr04 205635377 4e-25
CaES5029 Pepper.v.1.5.chr04 205666777 2e-33
CaES3524 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr04 205666777 1e-23
CaES5068 Pepper.v.1.5.chr04 205681308 8e-80
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 307


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