Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr04

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 307


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1991 Pepper.v.1.5.chr04 93123856 1e-123
CaES2015 Pepper.v.1.5.chr04 5603191 1e-97
CaES2020 Pepper.v.1.5.chr04 206307956 6e-68
CaES2022 Pepper.v.1.5.chr04 140163580 4e-69
CaES2036 Pepper.v.1.5.chr04 201914034 1e-107
CaES2045 Pepper.v.1.5.chr04 188559823 1e-103
CaES2060 Pepper.v.1.5.chr04 13959304 3e-48
CaES2065 Pepper.v.1.5.chr04 205682834 1e-142
CaES2113 Pepper.v.1.5.chr04 192590355 2e-97
CaES2120 Pepper.v.1.5.chr04 175671752 1e-135
CaES2121 Pepper.v.1.5.chr04 161316039 3e-59
CaES2129 Pepper.v.1.5.chr04 41270732 1e-120
CaES2130 Pepper.v.1.5.chr04 9404051 1e-109
CaES2140 Pepper.v.1.5.chr04 147254073 1e-102
CaES2167 Pepper.v.1.5.chr04 205064140 1e-124
CaES2187 Pepper.v.1.5.chr04 95554666 1e-140
CaES2201 Pepper.v.1.5.chr04 185513018 1e-106
CaES2210 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr04 13953656 9e-52
CaES2224 Pepper.v.1.5.chr04 202285746 1e-125
CaES2242 Pepper.v.1.5.chr04 41846148 1e-141
CaES2247 Pepper.v.1.5.chr04 205007886 1e-127
CaES2251 Pepper.v.1.5.chr04 98355941 7e-37
CaES2298 Pepper.v.1.5.chr04 206277547 1e-73
CaES2302 Pepper.v.1.5.chr04 5594280 1e-116
CaES2318 Pepper.v.1.5.chr04 82505752 1e-62
CaES2319 Pepper.v.1.5.chr04 201911405 1e-109
CaES2387 Pepper.v.1.5.chr04 125864339 5e-50
CaES2399 Pepper.v.1.5.chr04 205323605 6e-72
CaES2401 Pepper.v.1.5.chr04 120815876 2e-33
CaES2428 Pepper.v.1.5.chr04 57309616 1e-134
CaES2431 Pepper.v.1.5.chr04 109840309 1e-115
CaES2488 Pepper.v.1.5.chr04 198066430 1e-100
CaES2507 Pepper.v.1.5.chr04 8352461 4e-63
CaES2512 Pepper.v.1.5.chr04 5930011 4e-79
CaES2513 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr04 150718834 3e-41
CaES2514 Pepper.v.1.5.chr04 12743693 1e-123
CaES2515 Pepper.v.1.5.chr04 6257681 4e-72
CaES2543 Pepper.v.1.5.chr04 88553298 4e-39
CaES2590 Pepper.v.1.5.chr04 59107903 1e-112
CaES2612 Pepper.v.1.5.chr04 44209850 1e-132
CaES2619 Pepper.v.1.5.chr04 150711936 1e-138
CaES2635 Pepper.v.1.5.chr04 189456356 1e-22
CaES2656 Pepper.v.1.5.chr04 202671535 1e-141
CaES2676 Pepper.v.1.5.chr04 73844467 1e-139
CaES2682 Pepper.v.1.5.chr04 149672045 3e-90
CaES2701 Pepper.v.1.5.chr04 14733597 3e-56
CaES2705 Pepper.v.1.5.chr04 202382070 1e-147
CaES2716 Pepper.v.1.5.chr04 12735248 1e-137
CaES2726 Pepper.v.1.5.chr04 6815214 1e-117
CaES2728 Pepper.v.1.5.chr04 113510893 2e-40
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 307


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