Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)		 Evalue
Name Position*
CaES0012 Pepper.v.1.5.chr03 216075289 7e-91
CaES0023 Pepper.v.1.5.chr03 162006299 2e-50
CaES0024 Pepper.v.1.5.chr03 47991242 1e-123
CaES0039 Pepper.v.1.5.chr03 67167920 1e-102
CaES0051 Pepper.v.1.5.chr03 47990931 4e-43
CaES0052 Pepper.v.1.5.chr03 232716638 2e-28
CaES0059 Pepper.v.1.5.chr03 22795078 5e-47
CaES0064 Pepper.v.1.5.chr03 237875900 1e-91
CaES0066 Pepper.v.1.5.chr03 214625782 2e-97
CaES0072 Pepper.v.1.5.chr03 17399366 7e-93
CaES0075 Pepper.v.1.5.chr03 214506187 1e-122
CaES0079 Pepper.v.1.5.chr03 240463224 1e-115
CaES0081 Pepper.v.1.5.chr03 140714803 1e-147
CaES0092 Pepper.v.1.5.chr03 180847739 3e-36
CaES0096 Pepper.v.1.5.chr03 200610610 6e-61
CaES0104 Pepper.v.1.5.chr03 212531480 4e-84
CaES0114 Pepper.v.1.5.chr03 206559603 8e-89
CaES0125 Pepper.v.1.5.chr03 240113343 1e-108
CaES0132 Pepper.v.1.5.chr03 234805126 4e-36
CaES0163 Pepper.v.1.5.chr03 68608359 1e-147
CaES0191 Pepper.v.1.5.chr03 21151149 1e-148
CaES0204 Pepper.v.1.5.chr03 238260841 7e-81
CaES0212 Pepper.v.1.5.chr03 178877860 1e-117
CaES0213 Pepper.v.1.5.chr03 218762996 6e-93
CaES0217 Pepper.v.1.5.chr03 216027842 1e-107
CaES0225 Pepper.v.1.5.chr03 239585369 1e-108
CaES0227 Pepper.v.1.5.chr03 234890027 1e-120
CaES0232 Pepper.v.1.5.chr03 236795941 1e-123
CaES0247 Pepper.v.1.5.chr03 232094741 8e-28
CaES0255 Pepper.v.1.5.chr03 224674219 4e-66
CaES0306 Pepper.v.1.5.chr03 205747799 6e-83
CaES0318 Pepper.v.1.5.chr03 226130569 3e-50
CaES0339 Pepper.v.1.5.chr03 236110131 1e-112
CaES0350 Pepper.v.1.5.chr03 214871936 1e-63
CaES0363 Pepper.v.1.5.chr03 208652227 3e-94
CaES0369 Pepper.v.1.5.chr03 25257610 3e-97
CaES0370 Pepper.v.1.5.chr03 196340327 1e-136
CaES0371 Pepper.v.1.5.chr03 237838187 3e-96
CaES0376 Pepper.v.1.5.chr03 216434313 6e-49
CaES0384 Pepper.v.1.5.chr03 26404636 4e-80
CaES0385 Pepper.v.1.5.chr03 20799712 2e-91
CaES0389 Pepper.v.1.5.chr03 206403376 1e-128
CaES0401 Pepper.v.1.5.chr03 45414433 1e-50
CaES0404 0.321 190 Pepper.v.1.5.chr03 212583251 9e-41
CaES0411 Pepper.v.1.5.chr03 218817883 1e-47
CaES0420 Pepper.v.1.5.chr03 203438153 1e-141
CaES0429 Pepper.v.1.5.chr03 1238441 4e-61
CaES0431 Pepper.v.1.5.chr03 207378586 1e-121
CaES0433 Pepper.v.1.5.chr03 216029761 1e-147
CaES0469 Pepper.v.1.5.chr03 207830804 1e-170
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568

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