Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1959 Pepper.v.1.5.chr03 214913581 1e-125
CaES3508 Pepper.v.1.5.chr03 215107112 4e-56
CaES3618 Pepper.v.1.5.chr03 215125273 1e-95
CaES4763 Pepper.v.1.5.chr03 216027067 1e-153
CaES0217 Pepper.v.1.5.chr03 216027842 1e-107
CaES0433 Pepper.v.1.5.chr03 216029761 1e-147
CaES3329 Pepper.v.1.5.chr03 216030091 3e-81
CaES0012 Pepper.v.1.5.chr03 216075289 7e-91
CaES4447 Pepper.v.1.5.chr03 216265171 1e-123
CaES5272 Pepper.v.1.5.chr03 216354572 1e-93
CaES1307 Pepper.v.1.5.chr03 216431568 6e-70
CaES0376 Pepper.v.1.5.chr03 216434313 6e-49
CaES3546 Pepper.v.1.5.chr03 216437418 9e-58
CaES2660 Pepper.v.1.5.chr03 216610711 1e-136
CaES2156 Pepper.v.1.5.chr03 217160932 1e-107
CaES3911 Pepper.v.1.5.chr03 217207020 1e-144
CaES2578 Pepper.v.1.5.chr03 217591303 1e-130
CaES1618 Pepper.v.1.5.chr03 217659889 3e-43
CaES5095 Pepper.v.1.5.chr03 217750548 2e-92
CaES5694 Pepper.v.1.5.chr03 217841833 3e-69
CaES4685 Pepper.v.1.5.chr03 217949532 1e-106
CaES4400 Pepper.v.1.5.chr03 218641187 4e-97
CaES4444 Pepper.v.1.5.chr03 218701617 7e-60
CaES1514 Pepper.v.1.5.chr03 218702258 5e-95
CaES4445 Pepper.v.1.5.chr03 218758368 1e-133
CaES0213 Pepper.v.1.5.chr03 218762996 6e-93
CaES1954 Pepper.v.1.5.chr03 218784412 1e-124
CaES0411 Pepper.v.1.5.chr03 218817883 1e-47
CaES3905 Pepper.v.1.5.chr03 219144770 1e-107
CaES3878 Pepper.v.1.5.chr03 219159541 1e-126
CaES2787 Pepper.v.1.5.chr03 219165138 5e-96
CaES4974 Pepper.v.1.5.chr03 220325469 1e-93
CaES1617 Pepper.v.1.5.chr03 220625743 2e-65
CaES2893 Pepper.v.1.5.chr03 220697700 2e-99
CaES1512 Pepper.v.1.5.chr03 220722386 3e-85
CaES1942 Pepper.v.1.5.chr03 220904265 1e-120
CaES4016 Pepper.v.1.5.chr03 221309574 1e-104
CaES2740 Pepper.v.1.5.chr03 221311308 1e-106
CaES3944 Pepper.v.1.5.chr03 221451248 1e-127
CaES0489 Pepper.v.1.5.chr03 221525422 3e-23
CaES0941 Pepper.v.1.5.chr03 222973554 1e-113
CaES1189 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr03 223235873 1e-112
CaES3883 Pepper.v.1.5.chr03 223307654 1e-107
CaES4373 Pepper.v.1.5.chr03 223342431 3e-80
CaES5715 Pepper.v.1.5.chr03 223343991 2e-33
CaES3416 Pepper.v.1.5.chr03 223415980 4e-23
CaES4323 Pepper.v.1.5.chr03 223573604 1e-130
CaES3472 Pepper.v.1.5.chr03 223889138 9e-97
CaES5662 Pepper.v.1.5.chr03 223916384 5e-88
CaES1915 Pepper.v.1.5.chr03 223916411 2e-79
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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