Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1882 Pepper.v.1.5.chr03 67553485 1e-100
CaES0901 Pepper.v.1.5.chr03 67629884 1e-149
CaES5609 Pepper.v.1.5.chr03 68235144 3e-95
CaES0163 Pepper.v.1.5.chr03 68608359 1e-147
CaES4634 Pepper.v.1.5.chr03 68890333 1e-111
CaES1847 Pepper.v.1.5.chr03 68897979 2e-27
CaES5097 Pepper.v.1.5.chr03 70839568 1e-137
CaES3522 Pepper.v.1.5.chr03 74804041 1e-112
CaES1603 Pepper.v.1.5.chr03 74804583 1e-109
CaES1119 Pepper.v.1.5.chr03 74981997 1e-54
CaES4359 Pepper.v.1.5.chr03 74997836 3e-77
CaES1073 Pepper.v.1.5.chr03 75002745 1e-111
CaES4699 Pepper.v.1.5.chr03 75309193 1e-42
CaES5737 Pepper.v.1.5.chr03 75743273 1e-125
CaES3113 Pepper.v.1.5.chr03 75765226 1e-126
CaES1532 Pepper.v.1.5.chr03 76597023 6e-44
CaES0825 Pepper.v.1.5.chr03 78399716 1e-102
CaES4967 Pepper.v.1.5.chr03 83535643 1e-139
CaES2991 Pepper.v.1.5.chr03 89902021 1e-145
CaES5699 Pepper.v.1.5.chr03 90046385 5e-89
CaES2088 Pepper.v.1.5.chr03 90221429 1e-119
CaES5259 Pepper.v.1.5.chr03 93280064 1e-155
CaES3328 Pepper.v.1.5.chr03 93695339 6e-60
CaES5590 Pepper.v.1.5.chr03 94643286 1e-133
CaES4878 Pepper.v.1.5.chr03 94653805 1e-105
CaES4104 Pepper.v.1.5.chr03 97012219 1e-146
CaES3713 Pepper.v.1.5.chr03 97838394 1e-113
CaES0877 Pepper.v.1.5.chr03 104768520 7e-97
CaES5568 Pepper.v.1.5.chr03 109548798 1e-102
CaES0829 Pepper.v.1.5.chr03 118670210 2e-64
CaES4782 Pepper.v.1.5.chr03 123812168 7e-64
CaES2151 Pepper.v.1.5.chr03 126507014 1e-141
CaES5169 Pepper.v.1.5.chr03 126869433 1e-148
CaES2394 Pepper.v.1.5.chr03 127413360 1e-51
CaES3228 Pepper.v.1.5.chr03 129636630 1e-140
CaES2229 Pepper.v.1.5.chr03 129761111 4e-36
CaES3549 Pepper.v.1.5.chr03 131689969 1e-141
CaES2591 Pepper.v.1.5.chr03 132280945 1e-112
CaES5705 Pepper.v.1.5.chr03 132678730 1e-118
CaES2876 Pepper.v.1.5.chr03 134281745 1e-115
CaES4750 Pepper.v.1.5.chr03 136511148 5e-96
CaES1615 Pepper.v.1.5.chr03 137023850 1e-127
CaES4233 Pepper.v.1.5.chr03 137733004 1e-81
CaES4647 Pepper.v.1.5.chr03 138307175 1e-129
CaES0081 Pepper.v.1.5.chr03 140714803 1e-147
CaES5302 Pepper.v.1.5.chr03 143374599 4e-56
CaES2310 Pepper.v.1.5.chr03 144408281 1e-100
CaES4533 Pepper.v.1.5.chr03 145890722 1e-130
CaES4301 Pepper.v.1.5.chr03 147244350 3e-99
CaES5085 Pepper.v.1.5.chr03 147448974 2e-42
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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