Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr03

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 568


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES0384 Pepper.v.1.5.chr03 26404636 4e-80
CaES4427 Pepper.v.1.5.chr03 26827074 1e-118
CaES3818 Pepper.v.1.5.chr03 26867304 1e-115
CaES3867 Pepper.v.1.5.chr03 26868473 1e-141
CaES3083 Pepper.v.1.5.chr03 27436225 1e-110
CaES3843 Pepper.v.1.5.chr03 27619251 1e-86
CaES1906 Pepper.v.1.5.chr03 28267755 2e-42
CaES5391 Pepper.v.1.5.chr03 28424985 1e-67
CaES4614 Pepper.v.1.5.chr03 28425087 1e-115
CaES2803 Pepper.v.1.5.chr03 29432328 1e-106
CaES3566 Pepper.v.1.5.chr03 29435707 1e-103
CaES3287 Pepper.v.1.5.chr03 29436210 3e-73
CaES3398 Pepper.v.1.5.chr03 29436293 1e-105
CaES1710 Pepper.v.1.5.chr03 29437439 1e-126
CaES3081 Pepper.v.1.5.chr03 29493793 1e-109
CaES4919 Pepper.v.1.5.chr03 29539266 2e-80
CaES3102 Pepper.v.1.5.chr03 30175323 1e-138
CaES0990 Pepper.v.1.5.chr03 30597732 1e-106
CaES0544 Pepper.v.1.5.chr03 31502277 4e-87
CaES1457 Pepper.v.1.5.chr03 31926840 1e-121
CaES1593 Pepper.v.1.5.chr03 32109045 1e-106
CaES3874 Pepper.v.1.5.chr03 32877495 1e-132
CaES3225 Pepper.v.1.5.chr03 34296400 1e-85
CaES4377 Pepper.v.1.5.chr03 35352237 3e-22
CaES1957 Pepper.v.1.5.chr03 38799742 2e-83
CaES0892 Pepper.v.1.5.chr03 38802722 3e-86
CaES1563 Pepper.v.1.5.chr03 39185877 5e-41
CaES5583 Pepper.v.1.5.chr03 40043822 2e-66
CaES5411 Pepper.v.1.5.chr03 40061815 2e-84
CaES2648 Pepper.v.1.5.chr03 42376182 1e-122
CaES2923 Pepper.v.1.5.chr03 42534240 1e-159
CaES3519 Pepper.v.1.5.chr03 44411162 4e-54
CaES0401 Pepper.v.1.5.chr03 45414433 1e-50
CaES2505 0.288 192 Pepper.v.1.5.chr03 45414882 1e-105
CaES3066 Pepper.v.1.5.chr03 47755881 1e-130
CaES0051 Pepper.v.1.5.chr03 47990931 4e-43
CaES0024 Pepper.v.1.5.chr03 47991242 1e-123
CaES2206 Pepper.v.1.5.chr03 47991618 1e-172
CaES5052 Pepper.v.1.5.chr03 48520804 1e-144
CaES0563 Pepper.v.1.5.chr03 50745955 2e-80
CaES2754 Pepper.v.1.5.chr03 51096740 2e-30
CaES4906 Pepper.v.1.5.chr03 55395529 1e-126
CaES2495 Pepper.v.1.5.chr03 58313142 5e-31
CaES4474 Pepper.v.1.5.chr03 60008030 2e-79
CaES5141 Pepper.v.1.5.chr03 62726285 2e-53
CaES4463 Pepper.v.1.5.chr03 64144724 1e-122
CaES1340 Pepper.v.1.5.chr03 67014841 1e-147
CaES3894 Pepper.v.1.5.chr03 67167567 1e-112
CaES0039 Pepper.v.1.5.chr03 67167920 1e-102
CaES3092 Pepper.v.1.5.chr03 67168289 1e-136
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 568


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