Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3962 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr01 35553286 1e-127
CaES3453 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr01 117258931 2e-56
CaES1003 0.095 192 Pepper.v.1.5.chr01 165736225 1e-121
CaES4072 0.115 191 Pepper.v.1.5.chr01 76794631 1e-115
CaES4376 0.396 149 Pepper.v.1.5.chr01 108109688 5e-26
CaES5301 0.432 188 Pepper.v.1.5.chr01 38037199 1e-36
CaES5508 Pepper.v.1.5.chr01 150880 2e-94
CaES5594 Pepper.v.1.5.chr01 246873 1e-85
CaES0047 Pepper.v.1.5.chr01 273713 1e-132
CaES0732 Pepper.v.1.5.chr01 274657 1e-146
CaES0719 Pepper.v.1.5.chr01 326540 3e-25
CaES3995 Pepper.v.1.5.chr01 379999 1e-152
CaES4416 Pepper.v.1.5.chr01 546949 1e-93
CaES4618 Pepper.v.1.5.chr01 608600 2e-94
CaES3876 Pepper.v.1.5.chr01 668625 1e-137
CaES0372 Pepper.v.1.5.chr01 726854 2e-51
CaES4097 Pepper.v.1.5.chr01 727731 6e-31
CaES0181 Pepper.v.1.5.chr01 727770 3e-78
CaES0943 Pepper.v.1.5.chr01 753054 9e-35
CaES3608 Pepper.v.1.5.chr01 753099 3e-24
CaES0812 Pepper.v.1.5.chr01 1071157 1e-119
CaES4732 Pepper.v.1.5.chr01 1149560 1e-150
CaES4917 Pepper.v.1.5.chr01 1272595 1e-104
CaES1325 Pepper.v.1.5.chr01 1295053 3e-49
CaES0293 Pepper.v.1.5.chr01 1319641 6e-98
CaES4082 Pepper.v.1.5.chr01 1331495 1e-125
CaES1868 Pepper.v.1.5.chr01 1373882 2e-45
CaES5075 Pepper.v.1.5.chr01 1505460 1e-131
CaES2391 Pepper.v.1.5.chr01 1505593 3e-95
CaES3275 Pepper.v.1.5.chr01 1739554 7e-49
CaES0460 Pepper.v.1.5.chr01 1913001 2e-93
CaES3042 Pepper.v.1.5.chr01 1917482 1e-144
CaES1265 Pepper.v.1.5.chr01 1927557 1e-141
CaES4534 Pepper.v.1.5.chr01 2089606 1e-132
CaES1157 Pepper.v.1.5.chr01 2169800 1e-116
CaES2230 Pepper.v.1.5.chr01 2250904 3e-79
CaES1104 Pepper.v.1.5.chr01 2308811 1e-149
CaES2625 Pepper.v.1.5.chr01 2438994 3e-86
CaES4005 Pepper.v.1.5.chr01 2530836 1e-122
CaES3203 Pepper.v.1.5.chr01 2652006 6e-70
CaES3449 Pepper.v.1.5.chr01 2698826 1e-52
CaES2808 Pepper.v.1.5.chr01 2848114 8e-81
CaES4588 Pepper.v.1.5.chr01 3023159 1e-82
CaES5060 Pepper.v.1.5.chr01 3093282 3e-27
CaES5509 Pepper.v.1.5.chr01 3292240 2e-61
CaES3614 Pepper.v.1.5.chr01 3594562 1e-100
CaES1410 Pepper.v.1.5.chr01 3621358 4e-46
CaES0665 Pepper.v.1.5.chr01 3662002 1e-110
CaES3812 Pepper.v.1.5.chr01 3767418 4e-87
CaES1204 Pepper.v.1.5.chr01 3800845 1e-111
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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