Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES4434 Pepper.v.1.5.chr01 37815720 9e-83
CaES4437 Pepper.v.1.5.chr01 12593955 4e-55
CaES4446 Pepper.v.1.5.chr01 12793127 1e-95
CaES4453 Pepper.v.1.5.chr01 216503549 1e-125
CaES4456 Pepper.v.1.5.chr01 206075027 1e-126
CaES4459 Pepper.v.1.5.chr01 29852204 3e-50
CaES4475 Pepper.v.1.5.chr01 66913008 1e-131
CaES4476 Pepper.v.1.5.chr01 233433713 2e-93
CaES4478 Pepper.v.1.5.chr01 130059975 3e-38
CaES4480 Pepper.v.1.5.chr01 227070556 6e-58
CaES4491 Pepper.v.1.5.chr01 21987484 9e-56
CaES4493 Pepper.v.1.5.chr01 158064760 1e-106
CaES4494 Pepper.v.1.5.chr01 215518936 2e-21
CaES4498 Pepper.v.1.5.chr01 249152908 2e-91
CaES4500 Pepper.v.1.5.chr01 244537069 2e-48
CaES4502 Pepper.v.1.5.chr01 222819995 1e-64
CaES4514 Pepper.v.1.5.chr01 244440266 1e-104
CaES4528 Pepper.v.1.5.chr01 75538402 1e-106
CaES4534 Pepper.v.1.5.chr01 2089606 1e-132
CaES4540 Pepper.v.1.5.chr01 83891142 1e-103
CaES4559 Pepper.v.1.5.chr01 236922829 1e-125
CaES4576 Pepper.v.1.5.chr01 140851600 1e-82
CaES4580 Pepper.v.1.5.chr01 141871002 1e-136
CaES4581 Pepper.v.1.5.chr01 29870714 1e-148
CaES4588 Pepper.v.1.5.chr01 3023159 1e-82
CaES4592 Pepper.v.1.5.chr01 216705641 1e-113
CaES4618 Pepper.v.1.5.chr01 608600 2e-94
CaES4619 Pepper.v.1.5.chr01 51394325 1e-141
CaES4621 Pepper.v.1.5.chr01 199725617 1e-125
CaES4623 Pepper.v.1.5.chr01 59134945 1e-75
CaES4652 Pepper.v.1.5.chr01 259092534 2e-29
CaES4661 Pepper.v.1.5.chr01 249076960 1e-111
CaES4663 Pepper.v.1.5.chr01 102797693 1e-91
CaES4671 Pepper.v.1.5.chr01 153452772 1e-97
CaES4684 Pepper.v.1.5.chr01 155096984 5e-73
CaES4698 Pepper.v.1.5.chr01 32430959 1e-95
CaES4713 Pepper.v.1.5.chr01 260570306 2e-77
CaES4732 Pepper.v.1.5.chr01 1149560 1e-150
CaES4736 Pepper.v.1.5.chr01 6817951 2e-97
CaES4743 Pepper.v.1.5.chr01 248530639 1e-125
CaES4747 Pepper.v.1.5.chr01 244440269 1e-139
CaES4753 Pepper.v.1.5.chr01 174644418 1e-28
CaES4771 Pepper.v.1.5.chr01 246817641 1e-142
CaES4781 Pepper.v.1.5.chr01 23485716 1e-128
CaES4784 Pepper.v.1.5.chr01 244056911 1e-115
CaES4803 Pepper.v.1.5.chr01 11279184 1e-129
CaES4805 Pepper.v.1.5.chr01 164892502 2e-65
CaES4830 Pepper.v.1.5.chr01 203288882 1e-126
CaES4868 Pepper.v.1.5.chr01 174071878 1e-122
CaES4914 Pepper.v.1.5.chr01 219451756 1e-138
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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