Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES1562 Pepper.v.1.5.chr01 195952076 9e-48
CaES5750 Pepper.v.1.5.chr01 196165103 9e-54
CaES5372 Pepper.v.1.5.chr01 196165108 8e-56
CaES2087 Pepper.v.1.5.chr01 196472054 1e-122
CaES0705 Pepper.v.1.5.chr01 196877711 4e-98
CaES4418 Pepper.v.1.5.chr01 197794866 1e-139
CaES4981 Pepper.v.1.5.chr01 198213315 1e-130
CaES4621 Pepper.v.1.5.chr01 199725617 1e-125
CaES2250 Pepper.v.1.5.chr01 200244115 1e-130
CaES3012 Pepper.v.1.5.chr01 200340192 1e-126
CaES3693 Pepper.v.1.5.chr01 203266399 1e-113
CaES4830 Pepper.v.1.5.chr01 203288882 1e-126
CaES1706 Pepper.v.1.5.chr01 203300145 1e-125
CaES4414 Pepper.v.1.5.chr01 205657835 1e-116
CaES3755 Pepper.v.1.5.chr01 206071829 7e-69
CaES4456 Pepper.v.1.5.chr01 206075027 1e-126
CaES1114 Pepper.v.1.5.chr01 206618538 1e-129
CaES4205 Pepper.v.1.5.chr01 206624164 1e-123
CaES5331 Pepper.v.1.5.chr01 206659896 1e-103
CaES3732 Pepper.v.1.5.chr01 207192832 1e-109
CaES4398 Pepper.v.1.5.chr01 208506685 1e-137
CaES1768 Pepper.v.1.5.chr01 208640340 1e-113
CaES5443 Pepper.v.1.5.chr01 208640972 2e-54
CaES5569 Pepper.v.1.5.chr01 209624641 1e-36
CaES4388 Pepper.v.1.5.chr01 209624963 1e-49
CaES4396 Pepper.v.1.5.chr01 210468780 1e-91
CaES0533 Pepper.v.1.5.chr01 210469423 6e-85
CaES3266 Pepper.v.1.5.chr01 211302199 1e-128
CaES1527 Pepper.v.1.5.chr01 212938629 1e-127
CaES1143 Pepper.v.1.5.chr01 212983184 1e-115
CaES2162 Pepper.v.1.5.chr01 213119421 1e-122
CaES2675 Pepper.v.1.5.chr01 213169986 1e-116
CaES2535 Pepper.v.1.5.chr01 213273702 1e-115
CaES3972 Pepper.v.1.5.chr01 213823318 1e-138
CaES3109 Pepper.v.1.5.chr01 214298581 1e-138
CaES1951 Pepper.v.1.5.chr01 214309339 5e-54
CaES3261 Pepper.v.1.5.chr01 214524016 9e-64
CaES4494 Pepper.v.1.5.chr01 215518936 2e-21
CaES0549 Pepper.v.1.5.chr01 215838844 1e-121
CaES3152 Pepper.v.1.5.chr01 216410310 1e-133
CaES4453 Pepper.v.1.5.chr01 216503549 1e-125
CaES2423 Pepper.v.1.5.chr01 216504973 2e-71
CaES4389 Pepper.v.1.5.chr01 216540791 1e-136
CaES4592 Pepper.v.1.5.chr01 216705641 1e-113
CaES0090 Pepper.v.1.5.chr01 216745596 1e-132
CaES0735 Pepper.v.1.5.chr01 217101388 1e-128
CaES5516 Pepper.v.1.5.chr01 217505939 3e-53
CaES3619 Pepper.v.1.5.chr01 217756577 5e-80
CaES3018 Pepper.v.1.5.chr01 218542024 3e-93
CaES5487 Pepper.v.1.5.chr01 218892381 3e-76
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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