Pepper Marker Database

Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet) list : Pepper.v.1.5.chr01

Order of Pepper markers and Pepper gene models

Pepper markers on the Pepper genome (Pepper.v.1.5, Kim et al. 2014 Nat Genet)

Total Entries: 544


Marker Color EST-SNP EST-SSR Genome-SSR Intron-SNP

Marker Name PIC value PIC lines Genome
(Pepper.v.1.5)
Evalue
Name Position*
CaES3449 Pepper.v.1.5.chr01 2698826 1e-52
CaES3452 Pepper.v.1.5.chr01 251871464 1e-147
CaES3453 0.0 0 Pepper.v.1.5.chr01 117258931 2e-56
CaES3465 Pepper.v.1.5.chr01 12864067 1e-124
CaES3476 Pepper.v.1.5.chr01 255536973 4e-82
CaES3503 Pepper.v.1.5.chr01 170019311 1e-133
CaES3512 Pepper.v.1.5.chr01 190047757 1e-124
CaES3529 Pepper.v.1.5.chr01 243025794 1e-83
CaES3556 Pepper.v.1.5.chr01 162840797 1e-114
CaES3562 Pepper.v.1.5.chr01 251716147 1e-104
CaES3572 Pepper.v.1.5.chr01 82579809 8e-95
CaES3595 Pepper.v.1.5.chr01 180898766 2e-75
CaES3598 Pepper.v.1.5.chr01 175208758 1e-115
CaES3607 Pepper.v.1.5.chr01 67767718 6e-22
CaES3608 Pepper.v.1.5.chr01 753099 3e-24
CaES3614 Pepper.v.1.5.chr01 3594562 1e-100
CaES3619 Pepper.v.1.5.chr01 217756577 5e-80
CaES3693 Pepper.v.1.5.chr01 203266399 1e-113
CaES3711 Pepper.v.1.5.chr01 248679607 1e-85
CaES3717 Pepper.v.1.5.chr01 175932788 1e-118
CaES3724 Pepper.v.1.5.chr01 55797869 2e-92
CaES3727 Pepper.v.1.5.chr01 37087608 1e-139
CaES3732 Pepper.v.1.5.chr01 207192832 1e-109
CaES3743 Pepper.v.1.5.chr01 4123783 2e-93
CaES3755 Pepper.v.1.5.chr01 206071829 7e-69
CaES3759 Pepper.v.1.5.chr01 192927070 1e-115
CaES3778 Pepper.v.1.5.chr01 157670854 1e-164
CaES3795 Pepper.v.1.5.chr01 4223889 1e-115
CaES3799 Pepper.v.1.5.chr01 6198396 3e-46
CaES3812 Pepper.v.1.5.chr01 3767418 4e-87
CaES3855 Pepper.v.1.5.chr01 219679655 1e-118
CaES3861 Pepper.v.1.5.chr01 4159073 1e-126
CaES3863 Pepper.v.1.5.chr01 150483346 2e-32
CaES3868 Pepper.v.1.5.chr01 154334553 7e-29
CaES3876 Pepper.v.1.5.chr01 668625 1e-137
CaES3887 Pepper.v.1.5.chr01 261422043 1e-141
CaES3898 Pepper.v.1.5.chr01 154440109 2e-75
CaES3899 Pepper.v.1.5.chr01 138442658 4e-30
CaES3903 Pepper.v.1.5.chr01 154371250 2e-60
CaES3957 Pepper.v.1.5.chr01 14608718 2e-67
CaES3962 0.0 192 Pepper.v.1.5.chr01 35553286 1e-127
CaES3966 Pepper.v.1.5.chr01 10507942 1e-105
CaES3972 Pepper.v.1.5.chr01 213823318 1e-138
CaES3980 Pepper.v.1.5.chr01 218897200 1e-127
CaES3986 Pepper.v.1.5.chr01 245571111 1e-119
CaES3995 Pepper.v.1.5.chr01 379999 1e-152
CaES3999 Pepper.v.1.5.chr01 36927420 1e-119
CaES4000 Pepper.v.1.5.chr01 125646776 1e-110
CaES4005 Pepper.v.1.5.chr01 2530836 1e-122
CaES4011 Pepper.v.1.5.chr01 6161446 1e-119
* Best match positions of the marker sequences to the genome databases using tblastx (<1e-20) without filtering query sequence.

Total Entries: 544


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